（六）明确课题依托单位。一个课题只能确立一个依托单位。依托单位必须具备必要的课题实施条件，有健全的科研管理制度、财务管理制度、资产管理制度和会计核算制度。法人课题责任是当然的依托单位。
（七）明确课题责任人与依托单位之间的关系。课题责任人对完成课题任务承担法律责任，依托单位必须提供课题任务书或课题合同中确立的支持条件。属于自然人的课题责任人与课题依托单位之间可以根据课题实施的需要，打破单位、所有制界限进行优化组合。课题责任人与依托单位之间的权利义务关系以合同的形式确定。
（八）允许跨部门、跨单位择优聘用课题组成员。课题责任人应组成一个结构精干、人员相对稳定的课题组，课题组人数及主要成员应符合各科研计划管理办法的要求，并由归口部门确认。
三、课题的组织管理
（九）国家科研计划实行归口管理。归口部门主要履行管理、指导和监督职能。
（十）明确课题研究的层次。根据实际需要课题可实行“课题一子课题”或“项目一课题”两级管理。课题研究的分级情况必须在合同或任务书中明确，不得自行分解或随意变更。实行两级管理的课题，由课题责任人负责签订课题分级合同，并报归口部门备案。
（十一）明确课题管理和课题研究各方的职责。在各科研计划管理办法中要明确各有关部门、课题依托单位以及课题责任人的责权利，并在合同或任务书中详细规定。
（十二）实行重大事项报告制度。课题责任人对课题执行过程中发生的技术路线或主要研究内容调整、课题组主要研究人员变动以及其他可能影响课题顺利完成的重大事项要及时向归口部门报告，并按各科研计划管理办法规定的程序报批。
四、经费管理
（十三）加强预算管理，实行预算评估或评审。归口部门会同财政部门对课题预算的目标相关性、政策相符性和经济合理性等进行审核，确定课题经费预算。
（十四）合理确定课题资助方式。根据课题规模以及管理工作的需要，课题资助方式分为成本补偿式和定额补助式。
成本补偿式是指对受资助课题的成本费用进行补偿的资助方式，最高为全额。由归口部门会同财政部门对此类课题预算建议书进行审查并批复，课题支出必须严格按照批复的预算执行。
定额补助式是指对受资助课题提供固定数额经费的资助方式，资助额度依据评议专家的意见和相关的财政、财务政策并按照规定的程序审核后确定，资助额度一经确定，不能调整。
