表６ 与蛋白质序列相关的特征关键词表
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│ 关键词 │ 说明 │
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│CONFLICT │不同的论文报道了不同的序列 │
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│VARIANT │作者报道存在序列变体 │
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│VARSLIC │由可选择的剪接产生的序列变体的表述 │
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│MUTAGEN │经实验操作已改变的位点 │
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│MOD_RES │残基的翻译后修饰 │
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│ACETYLATION │N－末端或其它 │
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│AMIDATION │通常位于成熟的活性肽的C－末端 │
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│BLOCKED │不能被测定的N－或C－末端封闭基团 │
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│FORMYLATION │N－末端甲硫氨酸的 │
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│GAMMA-CARBOXY- │天冬酰胺，天冬氨酸，脯氨酸或赖氨酸的 │
│GLUTAMIC ACID │ │
│HYDROXYLATION │ │
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│METHYLATION │通常为赖氨酸或精氨酸的 │
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│PHOSPHORYLATION │丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸，天冬氨酸或组氨酸的 │
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│PYRROLIDONE │已形成内部环内酰胺的N－末端谷氨酸 │
│CARBOXYLICACID │ │
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│SULFATATION │通常为酪氨酸的 │
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│LIPID │脂质组成成分的共价结合 │
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│MYRISTATE │通过酰胺键与蛋白质成熟形式的N－末端甘氨酸残基或内 │
│ │部的赖氨酸残基结合的豆蔻酸基团 │
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│PALMITATE │通过硫酯键与半胱氨酸残基或通过酯键与丝氨酸或苏氨酸│
│ │残基结合的棕榈酸基团 │
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│FARNESYL │通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的法尼基 │
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│GERANYL-GERANYL │通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的香叶基－香叶基基团 │
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│GPI_ANCHOR │与蛋白质成熟形式Ｃ－末端残基的α－羧基相连的糖基－│
│ │磷脂酰肌醇（GPI）基团 │
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│N_ACYL │原核生物脂蛋白成熟形式的N－末端半胱氨酸，所述脂蛋 │
│DIGLYCERIDE │白具有酰胺－键联的脂肪酸和通过酯键连接了两个脂肪酸│
│ │的甘油基 │
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│DISULFID │二硫键；“FROM”和“TO”终点表示通过一个链－内二硫│
│ │键连接的两个残基；如果“FROM”和“TO”终点是完全相│
│ │同的，则二硫键是链－间键，而说明书领域示出交联的性│
│ │质 │
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│THIOLEST │硫醇酯键；“FROM”和“TO”终点表示通过硫醇酯键连接│
│ │的两个残基 │
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│THIOETH │硫醚键；“FROM”和“TO”终点表示通过硫醚键连接的两│
│ │个残基 │
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│CARBOHYD │糖基化位点；碳水化物（如果已知）的性质在说明书领域│
│ │给出 │
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│METAL │金属离子的结合位点；说明书领域示出金属的性质 │
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│BINDING │任何化学基团（辅酶，辅基，等等）的结合位点；基团的│
│ │化学性质在说明书领域给出 │
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│SIGNAL │信号序列的范围（前肽） │
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│TRANSIT │运转肽的范围（线粒体，叶绿体或微体） │
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│PROPEP │前肽的范围 │
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│CHAIN │成熟蛋白质中多肽链的范围 │
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│PEPTIDE │被释放的活性肽的范围 │
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│DOMAIN │序列中感兴趣的区域的范围；所述区域的特征在说明书领│
│ │域给出 │
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│CA_BIND │钙－结合区域的范围 │
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│DNA_BIND │DNA-－结合区域的范围 │
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│NP_BIND │核苷酸磷酸酯结合区域；核苷酸磷酸酯的特征示于说明书│
│ │领域 │
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│TRANSMEM │转膜区域的范围 │
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│ZN_FING │锌指区域的范围 │
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│SIMILAR │与另一个蛋白质序列具有相似性的区域；与那个序列有关│
│ │的精确的资料在说明书领域给出 │
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│REPEAT │内部序列重复的范围 │
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│HELIX │二级结构；螺旋，例如α－螺旋，３（10）螺旋，或Pi- │
│ │螺旋 │
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│STRAND │二级结构；β－链，例如氢键连接的β－链，或分离的β│
│ │－桥中的残基 │
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│TURN │二级结构转角，例如Ｈ－键连的转角（３－转角，４－转│
│ │角或５－转角） │
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│ACT_SITE │涉及酶活性的氨基酸 │
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│SITE │序列中任何其它感兴趣的位点 │
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│INIT_MET │已知序列以起始密码子甲硫氨酸开始 │
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│NON_TER │序列末端的残基不是末端残基；如果应用于位置１，这表│
│ │示第一个位置不是完整分子的Ｎ－末端；如果应用于最后│
│ │一个位置，这表示此位置不是完整分子的Ｃ－末端；对此│
│ │关键词没有说明书领域 │
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│NON_CONS │非连串残基；表示序列中的两个残基不是连串的，在它们│
│ │之间有很多末测序的残基 │
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│UNSURE │序列的不确定性；用于表述不能确定序列排列的序列区域│
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