第六条 农业、水利、林业、气象主管部门（以下简称主管部门）应将本级农业专项资金按规定的预算编制时间报送同级财政部门，并报专项资金的项目支出预算。
第七条 各级财政的农财部门应按规定的预算编制时间，将需设立的补助下级财政农业专项资金报送同级预算编制部门，并报专项资金的项目支出内容。
第八条 农业专项资金执行到规定的期限应自动停止。到期后如需继续执行，应按照规定的程序重新申报。
第三章 农业专项资金的申报与分配
第九条 财政部门负责农业专项资金的分配管理，制定有关专项资金的管理办法。
第十条 财政部门或主管部门应将重要农业专项资金的用途、补助标准及其他要求以项目指南等形式予以公告。
第十一条 农业专项资金的申报部门，是指申报项目所在地的财政部门或主管部门。申报部门应按照财政管理体制或财务关系，以正式文件逐级上报申报项目，不得越级上报文件。按照分级负责的原则，各级地方财政部门或主管部门应对上报项目的真实性和文件的合规性负责。
第十二条 农业专项资金的项目申请单位，即项目单位。项目申请单位应符合规定的资格或条件，提供本单位的组织形式、资产和财务状况，对农民收入、农业农村发展的贡献，以前实施农业项目的绩效等有关情况。
农业专项资金支持的项目以社会效益和生态效益为主。对以经济效益为主、能带动农民增收的项目，项目申请单位应以公司制为主。
第十三条 为保证项目申报文件的真实、科学和完整，项目申请单位应提交项目可行性研究报告。
项目可行性研究报告可以委托专家或社会中介组织编写。接受委托编写项目可行性研究报告的社会中介组织应具备相应的资质条件。
第十四条 财政部门可发布财政农业专项资金管理标准文本。申请有关专项资金的项目单位应按规定提供合格的项目标准文本及必要的附件。
