借：储蓄通存通兑往来
或借：借记卡往来
贷：活期储蓄存款
或贷：单位金穗借记卡
或贷：个人金穗借记卡
主办行会计分录为：
借：其他应收款－－应收证券款项
贷：储蓄通存通兑往来
或贷：借记卡往来
日终，各开户行应打印通存通兑流水清单凭以编制“储蓄通存通兑往来”、“借记卡往来”与“活期储蓄存款”、“单位金穗借记卡”和“个人金穗借记卡”科目汇总记账凭证，办理日终的账务处理。通存通兑流水清单专夹保存，按月装订列入会计档案保管。
第五条 投资人申购新股（含增发和配售股票）以及配股的会计核算视同买入证券的会计处理；申购失败或申购未成功的资金，在指定工作日内退还投资人存款账户。
第六条 分配红利的会计核算视同卖出证券的会计处理。
第七条 资金清算的核算
（一）银行内部资金清算
办理银证通业务发生的汇差资金通过“储蓄通存通兑往来”和“借记卡往来”科目并入储蓄通存通兑业务和借记卡业务进行清算，资金清算自上而下，分级进行。
（二）与证券公司的资金清算
1、与证券公司采取T＋0的方式进行资金清算。
日终，主办行收到业务处理中心的清算数据，打印“成功交易明细清单”和“资金差额报告表”，与证券公司提供的清算数据进行核对，无误后进行账务处理。
（1）应付证券公司款项（买差）时，会计分录为：
借：其他应付款－－应付证券款项
贷：其他应收款－－应收证券款项
贷：证券公司转存款－－××证券公司
贷：中间业务收入（银证通业务手续费）
（2）应收证券公司款项（卖差）时，如证券公司账户资金足以支付时，会计分录为：
借：证券公司转存款－－××证券公司
借：其他应付款－－应付证券款项
贷：其他应收款－－应收证券款项
贷：中间业务收入（银证通业务手续费）
如证券公司账户资金不足支付时，主办行应及时通知证券公司弥补透支额，如证券公司未能及时补足差额，则由主办行按透支额以临时借款的形式弥补透支额，会计分录为：
借：证券公司转存款－－××证券公司
