清理整顿道路客货运输秩序的基本目标是：通过清理整顿，力争用半年到一年的时间，使道路客货运输秩序基本好转，经营环境有较大改善政府对市场监管能力明显增强，行业整体形象明显改善，服务质量明显提高，促进销路客货运输行业的健康发展。
城市出租汽车等公共客运交通秩序的清理整顿工作，按照《
国务院办公厅转发建设部、交通部等部门关于清理整顿城市出租汽车等公共客运交通意见的通知》（国办发〔１９９９〕９４号）的规定实施。
二、清理整顿的主要内容及措施
（一）清理收费项目，减轻经营者负担。
地方各级人民政府的财政、物价部门要会同交通、建设、公安等部门，对涉及道路客货运输的行政事业性上费和政府性基金项目进行全面清理。附法律、法规，国务院，财政部、国家计委，省、自治区、直辖市人民政府及其所属财政、物价部门批准的行政事业性收费项目，国务院或财政部批准的政府性基金项目外，其他涉及道路客货运输的行政事业性收费和政府性基金项目一律取消。对符合国家规定的涉及道路客货运输的行政事业性收费和政府性基金项目，不得擅自扩大征收范围和提高征收标准；对国家明令取消的行政事业性收费和政府性基金项目，未落实的，要予以严肃查处。在清理整顿期间，一律不得出台涉及道路客货运输的新的行政事业性收费和政府性基金项目。今后确需开征涉及道路客货运输的行政事业性收费项目，一律报经财政部、国家计委或省、自治区、直辖市人民政府批准；省、自治区、直辖市人民政府批准的行政事业性收费项目，要分别征得财政部、国家计委同意；确需开征涉及道路客货运输的政府性基金项目，一律报财政部批准；重要的项目，由财政部报国务院批准。
（二）打击非法营运，建立公平竞争的市场秩序。
省级人民政府要组织交通、建设、公安、工商等部门，强化对道路客货运输市场的监督和管理，开展打击非法营运的专项治理行动，整顿道路客货运输秩序。对未按规定领取有关主管部门核发的营运证件和超越核定范围经营的非法营运行为，必须予以取缔，并按国家有关规定进行处罚。地方各级交通部门要切实搞好运力调控，防止车辆运力的盲目增长，确保营运车辆合理的实载率，减少车辆相向空驶，制止恶性竞争。地方各级交通（主管）部门要加强对道路客货运输企业开业审查和年度审验，整顿期间，对经营业主进行一次全面审验。
