县以上各级财政部门除按上述原则编好本级农业收支预算外，还要对下级农业收支预算进行认真审核，加以汇总，纳入财政收支总预算，按法定程序上报审批。
审核农业收支预算的基本要求：
１、审核农业收支预算的安排，是否贯彻了党和国家对农业的基本方针、政策以及国家预算草案中关于编制农业收支预算草案的要求和有关规定。
２、审核农业收支预算的安排，是否符合预算管理体制的要求。
３、审核农业收支预算中，各专项资金的预算安排是否符合财政规定的用途，是否突出了重点。
４、审核农业收支预算表列款、项之间的口径是否得当，各行栏次的数字是否准确无误，预算收支说明的因素是否真实、可靠。
５、在审核过程中，如发现问题，应在尊重现行财政管理体制的前提下，与有关方面进行商议，加以纠正和解决。
各级财政部门对本级农业事业单位的预算支出，要在审核是否符合国家规定的农业事来发展计划、人员编制、支出标准以及设备购置、房屋修缮等方面的制度后核定。对实行预算经费包干、财务包干办法的单位，要深入了解上年预算执行情况，搞清包干结余和专项补贴经费结转情况，根据新的年度农业发展计划，科学合理地核定本年度经费和财务包干数额（实行一定几年包干办法的按原规定办理）。
（四）坚持按时报送农业收支预算草案
各省、自治区、直辖市的农业收支预算草案，除纳入财政总预算草案报送财政部外，农财处还应单独抄送我部农财司一式二份。计划单列市的农业收支预算草案在报送省、自治区财政厅的同时，抄送我部农财司一份。
二、加强农业收支预算的管理和执行分析工作
（一）及时掌握预算收支变化情况
各级财政部门，在预算执行过程中应及时掌握收支变化情况，根据客观实际需要，对年初预算进行适当调整，及时办理预算的追加、调减、上划、下划业务。同时，各级财政部门农财单位均应设置农业收支预算指标帐，以利于及时掌握农业收支的增减变化情况。
（二）及时办理缴拨款业务
各级财政部门要积极组织农业收入，把应该上交的款项及时、足额地缴入国库，同时，对亏损企业的亏损退库要按计划、按定额补贴退库。农业税减免要根据上级批准的数额及时退库，落实到应予减免照顾的纳税人。对农业拨款要按事业发展进度和农时季节及时拨付和核对，以保证资金需要。
