集装箱的进出站和５吨以上集装箱的到发按箱号管理。到发的集装箱应使用集装箱箱号卡片（格式一）或集装箱到发登记薄（格式二）进行登记和销号，集装箱箱号卡片销号后顺号装订保存。进出站的铁路集装箱（包括铁路利用的自备集装箱）应使用铁路集装箱出站单进行登记和销号，集装箱落地的按箱填写，原卡车回站的按批填写，铁路集装箱出站单甲乙联合对后顺号装订保存。有条件的车站应使用计算机进行集装箱箱号跟踪管理。
对站外存留的铁路集装箱和周转集装箱应按单位建立铁路集装箱站外存留日况表（格式三）。５吨、１０吨集装箱中转站应建立集装箱中转登记簿（格式四）。
办理站还应根据管理需要，建立其它台帐或作业单。
第１１条 办理站应每日与站外存箱单位核对铁路集装箱站外存留日况表，整理铁路集装箱出站单，及时催还没有按时送回车站的集装箱。
办理站应定期清查站内、站外的铁路集装箱。发现实际箱数和统计数据不符时，应查明原因。发现集装箱丢失，应及时报告铁路分局和铁路局。
在车站存放的集装箱禁止挪作它用，如有挪用，对挪用者核收规定费率２倍的集装箱留置费。在站外存留的铁路集装箱，应按规定核收集装箱留置费。
第１２条 对存留铁路集装箱的集装箱集散站，车站应派货运人员参与对铁路集装箱的管理。专用线办理铁路集装箱，应由车站货运人员按办理站条件对铁路集装箱进行管理。
第１３条 使用计算机管理集装箱，应便于货运人员作业，有保证现场作业信息及时正确入机的制度，能随时掌握现场动态和自动生成与现场实际一致的统计报告和台帐。
第１４条 集装箱装车和卸车时，应核对箱号，检查箱体和施封情况。
中转站发现中转集装箱施封锁（环）丢失、封印内容不符、施封失效时，应在当时清点箱内货物，补封并编制货运记录；但封印站名相符号码不符时，可不清点箱内货物和补封。发现中转集装箱破损，如不危及货物安全，可继续运送；如不能继续运送，应清点和检查箱内货物，进行换装，补封并编制货运记录。
到站卸车发现集装箱施封锁（环）丢失、封印内容不符、施封失效时，应在当时清点箱内货物并编制货运记录；发现集装箱破损可能危及货物安全时，应编制货运记录并会同收货人检查箱内货物。
