９．查出行政事业单位的违法违纪问题：凡自查出来的，在调整财务收支后，可按规定提留经费包干结余和专项资金；被查出来的，应没收其全部违法违纪收入，由单位用经费包干结余或自有资金上缴财政。
１０．违反物价、外汇法规和控制社会集团购买力规定的问题，按照国家现行的有关法规处理。
（二）大检查查出的企业违纪问题，除１９９３年７月１日以前发生的应由专项基金列支而挤占成本费用的部分要按规定进行调帐，如数冲减应付工资、应付福利费、盈余公积金等科目余额外，其余各项不再作调整帐目处理，一律按查出的违纪金额计算税收、利润和两项基金的计征额，照章收缴各项税款、利润和“两金”。查出应由被查单位缴纳的罚款和滞纳金，一律不得抵减计税利润；查出应由违纪责任者个人缴纳的罚款，由受罚人支付。
（三）各种应缴违法违纪款项，按国家现行的财政体制收缴，优先入库。如有拒不缴库的，由银行划拨扣缴。少数资金确有困难，补缴后会严重影响生产经营的单位，在报经批准后，可允许他们订出交款计划，分期分批交清。
通过银行汇缴的各项违法违纪资金，各级银行要及时办理汇缴手续，不得层层占压。
（四）各级业务主管部门在重点抽查中查出所属企业单位的违法违纪问题，对主管部门可视同自查处理。至于主管部门对所属企业单位，则可在国家规定的范围内，根据查出其违纪问题的情节严重程度，采取相应的处罚措施。
（五）对有严重违法违纪和屡查屡犯行为的直接责任人，除按现行财经法规给予经济处罚外，还应按照干部管理权限，给予必要的党纪、政纪处分；触犯刑律的，移交司法机关惩处。
（六）对阻挠、破坏检查的单位和个人，可视情节轻重，进行通报批评，或经本级人民政府同意后，采取其他制裁措施。
（七）要坚决保护坚持原则的检查人员，财会人员和举报人，决不允许对他们进行任何形式的打击报复，对打击报复的，要查明情况，严肃处理。
五、各级大检查办公室和有关部门对企业和单位报来的《自查报告表》，要认真进行分析、审定。对被查出的各种违反财经法纪问题，要向被查单位发出《检查结论和处理通知》，做到事实清楚、定性准确、处理恰当、手续完备。
各级大检查办公室发出的《检查结论和处理通知》，被查单位必须执行，如有不服的，可按财政部门的复议程序申请复议。
六、各省、自治区、直辖市和计划单列市大检查办公室，受财政部大检查办公室的委托，查出中央单位应交中央预算的违法违纪金额，地方可按实际入库金额分成２０％。此项分成收入，在解决大检查经费以后，用于发展生产。
