未经海关许可并补缴关税，新疆棉加工出口企业擅自出售以出顶进项下新疆棉、及其中间产品（半成品）、成品的，依据《
海关法行政处罚实施细则》第
三条第（四）项、第
五条的规定处罚。构成犯罪的，依法追究刑事责任。
第九条 未经海关批准，新疆棉加工出口企业擅自将新疆棉、及其中间产品（半成品）、成品转让、抵押、调换、发运的，或者将加工的新疆棉、及其中间产品（半成品）、成品串换的，依据《
海关法行政处罚实施细则》第
十一条第（二）项的规定处罚。
新疆棉加工企业在加工新疆棉期间，有关记录不真实或者数量短少不能提供正当理由的，依据《
海关法行政处罚实施细则》第
十一条第（三）项规定处罚。
第十条 新疆棉加工出口企业使用新疆棉加工的成品不能在规定期限内出口，需要内销的，应交验棉花进口配额许可证，并由海关按规定征收进口关税和进口环节增值税。新疆棉加工出口企业不能交验棉花进口配额许可证的，由海关依据《
海关法行政处罚实施细则》第
十条和《关于进一步完善加工贸易银行保证金台帐制度的意见》（国办发〔１９９９〕３５号文件）第七条的规定，没收货物或者处货物等值３０％至５０％的罚款。
第十一条 承运新疆棉的运输人在新疆棉进口出库转直接出口的转关运输过程中擅自出售新疆棉的，依据《
海关法行政处罚实施细则》第
三条第（四）项、第
五条的规定处罚。构成犯罪的，依法追究刑事责任。
