（四）动植物监管司
研究拟定出入境动植物检验检疫的规章、制度；组织实施出入境动植物及动植物产品检验检疫和监管；收集国外有关动植物病虫害疫情信息。
（五）检验监管司
研究拟定进出口商品质量检验、监督管理的规章、制度；组织实施进出口商品法定检验；组织实施进口许可制度的民用商品入境验证管理；管理进出口商品鉴定和一般包装、危险品包装检验；组织实施外商投资财产鉴定。
（六）认证监管司
研究拟定出入境检验检疫监督管理和质量认证认可工作的规章、制度；拟定实施进出口安全、卫生、包装和质量等许可管理的目录并组织实施；管理和组织实施与进出口有关的质量认证认可工作；负责涉外检验检疫鉴定机构的审核认可和监管检查。
（七）科技与国际合作司
研究拟定和组织实施出入境检验检疫科技发展规划、计划；组织重大科研项目攻关；管理出入境检验检疫技术法规和标准化工作；组织管理出入境检验检疫信息网络和仪器设备；组织技术引进、国际合作与技术交流；按照规定办理技术性贸易壁垒和检疫协议的实施工作；负责外事工作。
（八）人事司
研究拟定出入境检验检疫系统人事管理办法；按照干部管理权限管理局机关及下属出入境检验检疫机构的人事、机构编制及劳动工资，组织管理下属出入境检验检疫机构的教育培训；承办机关党委的日常工作。
（九）财务司
拟定出入境检验检疫系统财务、会计管理制度和基本建设、制服的管理办法；审核、汇总和下达财务收支和基本建设规划、年度计划；负责各种专项资金和物资的分配及管理；负责出入境检验检疫机构国有资产管理；负责机关财务管理。
机关党委。负责机关及在京直属单位的党群工作，办事机构设在人事司。
四、人员编制
国家出入境检验检疫局机关行政编制为１８０名。其中：局长１名，副局长４名，正副局长职数３２名（含机关党委专职副书记和局总工程师、总农艺师、总兽医师、总检疫医师各１名）。
离退休干部工作机构、后勤服务机构及编制，按有关规定另行核定。
五、其他事项
（一）出入境检疫传染病和监测传染病名录的确定、调整由卫生部委托国家出入境检验检疫局负责，以卫生部名义发布。
禁止入境动植物名录的确定、调整由农业部委托国家出入境检验检疫局负责，以农业部名义发布。
