第十八条 科学事业单位对同一期间发生的各项支出，应当按用途归集到事业支出和经营支出的相关科目中。无法直接归集的，应当在事业支出和经营支出的相关科目中合理分摊。
经营支出应当与经营收入配比。
第十九条 科学事业单位从财政部门和财务主管部门取得的有指定项目和用途并且要求单独核算的专项资金，应当在统一的会计帐簿中专项予以核算，按照规定的用途开支，并按照要求定期向财政部门和财务主管部门报告专项资金使用情况；项目完成后，应当报送专项资金支出决算和使用效果的书面报告，接受财政部门和财务主管部门的检查、验收。
第二十条 为加强支出管理，主要从事应用开发研究和科技服务的科学事业单位，以及其他有条件的单位，可根据专业业务及其辅助活动、生产经营活动以及经济管理的实际需要，实行内部成本费用管理办法。
第二十一条 实行内部成本费用管理办法的科学事业单位，应以研究室、业务部、课题组等为核算单位，以科研课题、项目、产品等为基本核算对象，进行多层次的成本费用核算。成本费用开支划分为：
（一）直接费用，即单位在科研、生产过程中直接耗用的材料、支付的工资及其他直接支出所发生的费用。直接费用直接计入科研课题、项目、产品等成本中。
（二）间接费用，即单位内各研究室、业务部、车间等部门为组织和管理科研生产活动所发生的费用。间接费用按一定比例分配计入各课题、项目和产品等成本中。
（三）期间费用，即单位行政管理部门为组织和管理科研生产经营活动所发生的管理费用、销售费用和财务费用等。
期间费用计入当期结余。
第二十二条 科学事业单位的实验厂、中试车间以及其他生产经营部门，应当实行独立核算，并参照执行同行业或者相近行业企业财务制度。因规模较小或者承担的科研试验和研制任务较重，不具备独立核算条件的，应当实行内部成本费用管理办法。
第二十三条 为保证国家事业财务管理体系的统一性和完整性，实行内部成本费用管理办法的科学事业单位，其成本费用应当按照支出用途分别归集到事业支出和经营支出的相关科目中。
