第十六条 凡经批准获奖的国防专用项目将在内部公布，基层单位在接到公布材料后，要及时以适当方式在本单位公布。自公布之日起３个月（异议期）内任何单位和个人都有权对获奖项目提出异议。
第十七条 对项目的异议要正式填写《国防专用国家级科学技术进步奖获奖项目异议书》，要在规定的异议期内将异议书及附件１式２份报送国防科技成果办公室。超过异议期的不予受理。
第十八条 凡属成果所有权，主要完成单位，主要完成人及其排列顺序的异议一般由申报部门自行处理。跨部门的合作项目由主申报部门会同有关部门协商解决，不能商妥者由评审该项目的行业组裁决。自公布之日起５个月内仍未处理完毕，则取消本年度授奖资格。
第十九条 凡属对项目授奖资格或授奖等级的异议，二、三等奖项目由评审该项目的行业组处理；一等奖项目由行业组提出处理意见报国防科技成果办公室，由国防科学技术进步奖评审委员会处理；申报部门对行业评审组的处理不服者，可请求国防科学技术进步奖评审委员会裁决。
第二十条 各级对异议的处理都要填写《国防专用国家级科学技术进步奖获奖项目异议处理表》，此表与异议书及附件一起归入项目文档。
第五章 授奖
第二十一条 凡经国防科学技术进步奖评审委员会内部公布后确认授奖的项目，由国家科学技术进步奖评审委员会核准后统一发奖。
第二十二条 每个项目只授国家级奖励１次。此前得过其他级别科学技术进步奖者，奖金只发差额部分，余数留在原发奖金部门（或单位）作为奖励基金，不得挪作他用。
第二十三条 奖金的发放应根据贡献大小合理分配，不搞平均主义。对主要完成者要给予重奖，他们所获奖金数应占该项奖金数的５０～７０％。各单位要逐项填写“国防专用国家级科学技术进步奖项目主要完成者奖金分配表”１份，报国防科技成果办公室备案。
第二十四条 各单位要大力加强奖金发放中的思想政治工作，提倡团结协作、发扬风格，如有弄虚作假或剽窃他人成果者，一经查实，即行撤销授奖资格，追回奖品、奖金，并视情节给予批评或处分。
