“十二五”高校科技工作的总体思路是：高举中国特色社会主义伟大旗帜，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，以科学发展为主题，以科教结合为主线，以提升自主创新能力为核心，以推进协同创新为战略选择，以体制机制改革为突破口，通过试点先行、重点突破，带动全局发展；着力提升基础研究和前沿技术研究的原始创新能力，着力提升关键共性技术的有效供给能力，着力提升支撑高质量创新人才培养的能力，着力提升服务国家和区域经济社会发展战略需求的能力，为加快转变经济发展方式、全面推进国家创新体系建设、实现创新型国家战略目标奠定坚实基础。
“十二五”高校科技工作要突出以下五个基本要求：
--坚持把科技创新与人才培养相结合作为本质要求。以高水平科学研究支撑高质量高等教育，以高质量的高等教育支撑自主创新能力持续提高，形成科学研究与人才培养有机结合新机制。
--坚持把推进协同创新作为战略选择。紧紧围绕国家重大战略需求和科学技术前沿领域，大力推进高校与高校、科研院所、行业企业、地方政府以及国际社会的深度合作，促进资源共享，提升原始创新能力和服务经济社会发展的能力。
--坚持把加强原始创新作为主攻方向。坚定不移地把增强原始创新能力作为高校科技发展的战略基点，确立基础研究在高校科技工作中的核心地位。
--坚持把人才队伍建设作为根本保障。充分发挥领军人才、创新团队和青年骨干人才队伍在科技创新中的关键作用，着力构建一支规模宏大、结构合理、具有强大创新能力的高素质人才队伍。
--坚持把深化体制机制改革作为强大动力。以科技管理体制和运行机制改革为着力点，破解长期困扰高校科技发展的深层次问题，以体制机制改革促进科技资源高效配置和综合集成，全面激发创新活力和创新动力。
（二）发展目标。
“十二五”高校科技发展的总体目标是：科技综合实力、原始创新能力显著提升，科技国际竞争力和学术影响力显著增强，高校创新体系基本建成，为教育强国、人才强国和科技强国建设奠定坚实基础。
努力实现以下主要目标：
--基础研究和前沿技术研究的原始创新能力显著增强。基础研究和前沿技术研究的若干领域取得重大突破；若干学科达到世界一流水平；一批协同创新平台成为具有重大国际影响的学术高地；把服务国家战略需求和鼓励自由探索结合起来，营造有利于科技人员潜心研究的环境；一批重点建设高校成为知识创新的策源地、深化教育改革的试验田和扩大开放的桥头堡。
--关键共性技术有效供给能力显著提高。服务国家重大战略需求，突破一批关键共性技术，开发一批重大技术装备；一批创新平台成为产业共性技术的研发基地和区域创新发展的引领阵地，为加快转变经济发展方式、发展战略性新兴产业提供强大支撑。
--高层次人才培养和汇聚能力进一步增强。形成高水平科学研究支撑高质量人才培养的稳定模式，培养一大批具有创新精神和创新能力的拔尖人才；造就和汇聚一批具有世界领先水平的科学家、科技领军人才和创新团队。
--科技创新的体制机制不断完善。科技创新的模式和机制改革取得明显进展，科技人员评价机制和科技资源配置方式改革取得实效，知识和技术转化、转移、扩散机制进一步完善，创新环境进一步优化。
--创新基地建设迈上新台阶。重点建设一批世界一流和高水平的基础研究和创新人才培养基地、对相关产业有显著支撑和引领作用的共性技术研发平台、高层次国际合作联合研发基地、高水平战略研究基地和不同形式协同创新平台。
（三）战略重点。
