五、《实施细则》第
八条第二款中铁水、铁水水联运货物，如果第一换装港是征收港口，到达港也是征收港口的，除经由秦皇岛港的煤炭外，暂由到达港按第一换装港费率计征港口建设费。经由秦皇岛港的煤炭，由第一换装港即秦皇岛港征收；如果第一换装港是征收港口，到达港不是征收港口的，由第一换装港直接计征港口建设费；第一换装港不是征收港口，无论到达港是否征收港口，都不计征港口建设费。
六、铁水铁联运货物，第一换装港是征收港口，由第一换装港征收。第一换装港是不征收港口，不计征港口建设费。
七、国内水转水运输的中转货物（包括船过船作业和代办中转的货物），凡未提离港口库场又直接办理装船转运（在不同作业区进行中转装卸作业的，要凭装卸作业区证明），并且其最终收货人不变的，则中转港口不再计征该项货物的港口建设费。如果货物在中转港口提离港口库场并重新办理托运手续或虽没有提离港口库场，但最终收货人发生变化的，应照征港口建设费。
八、国外进口经海关放行，需由水路运往国内其他港口的货物，到达港是征收港口的，由到达港按国外进口费率计征一次港口建设费；到达港不得征收港口，转运港是征收港口的，由转运港按国外进口费率计征一次港口建设费。
九、《实施细则》第
十条和
《征收办法》第
九条中，代收单位提取的手续费在未解缴代征单位的费款中扣除；代征单位提取的手续费在未存入专户的费款中扣除；并在报表中反映。代征单位对所收代收单位解缴的费款不再计提手续费。
十、《实施细则》附件二《港口建设费征收月报表》中的“港口建设费本期应缴额”是指已开出帐单后的数额；“港口建设费本期已缴额”是指已经划缴交通部的数额。
