第九条 代征或代收港口建设费不另制单据。在现行的货运费收单据上增列港口建设费费目，在向缴费人核收运杂费时，一并核收港口建设费。
第十条 代征或代收单位可按代征或代收的港口建设费征收额计提千分之五的手续费。
第十一条 港口建设费的收入实行专户管理。采取“专户存储，存款计息，汇款收费”的办法。代征和代管单位都应在所在地中国工商银行开立“交通部港口建设费专户”。此专户只能存入和划转，不能动支。
代收单位收到的费款（扣除千分之五手续费后的净额）应在三日内向代征单位结算交付。代征单位收到的费款（扣除千分之五手续费后的净额）应在三日内存入专户，并于月后三日内将费款连同专户存款利息收入一并汇缴交通部。
由代管单位归口管理的代征单位，其应缴费款连同专户存款利息收入应于月后三日内汇缴代管单位，代管单位应于月后十日内将费款及利息收入汇缴交通部。
第十二条 交通部和代管单位有权检查代征或代收单位的收缴情况。代征或代收单位不得漏征、少征港口建设费。有漏征或少征港口建设费时，必须负责追补应缴费款，在１８０天内能追补到的，仍可计提千分之五的手续费；逾期追补不到的，由代征或代收单位负责赔偿。
代征或代收单位有错征港口建设费时，必须及时更正。因错征需退回缴费人的费款，代收单位尚未解缴代征单位的费款中支付，代征单位从尚未存入专户的费款中支付。
第十三条 代征、代收、代管单位均不得截留、挪用、滞缴征收的港口建设费。发现有截留、挪用、滞缴的，除应追缴费款外，还应按日核收截留、挪用或滞缴金额千分之五的滞纳金。情节严重的，可处以截留、挪用或滞缴费款五倍以下的罚款。
第十四条 缴费人不按本实施细则缴纳港口建设费的，代征或代收单位有权追缴费款，并从应结算的次日起按日核收应缴费款千分之五的滞纳金。情节严重的，可酌情处以应缴费款五倍以下的罚款。对拒绝缴纳费款和罚款的，代征或代收单位可提请人民法院协助执行。
第十五条 缴费人同代征或代收单位在缴付港口建设费的问题上发生争议时，必须先按照代征或代收单位的决定缴费，然后向交通部申请复议，对复议不服的，可向人民法院起诉；缴费人也可直接向人民法院起诉。
第十六条 按照本实施细则规定所收的滞纳金作为港口建设费收入处理；所收取的罚款收入直接上交当地财政部门。
