然而，从全国的情况看，县（市）科技工作条件仍然比较差，科技基础薄弱，科技成果转化能力不强，地区间科技进步不平衡问题比较突出，县（市）科技工作仍是国家创新体系建设的薄弱环节。
“十二五”时期是全面建设小康社会的关键时期，是深化改革开放、加快转变经济发展方式的攻坚时期。党的十七届五中全会提出了以科学发展为主题、以加快转变经济发展方式为主线的战略部署，县（市）科技工作要与时俱进，积极引导科技要素向县域集聚，加速科技成果转化，加强人才引进、培养和使用，推进体制机制创新，营造更加良好的创新环境，在深入推进工业化、城镇化过程中同步推进农业现代化，实现工业化、城镇化、农业现代化“三化同步”。
二、指导思想和发展目标
（一）指导思想
以邓小平理论、“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，根据党的十七大、十七届三中、四中和五中全会精神，按照《
国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006-2020年）》提出的建设创新型国家的总体战略部署，认真落实国办转发科技部等四部门《关于推进县（市）科技进步的意见》和科技部等四部门《关于新形势下加强县（市）科技工作的意见》精神，切实加强基层科技工作，以推动县（市）经济社会更好更快发展为重点，促进科技成果的消化、吸收、再创新，大力提升县（市）科技成果的转化应用水平，增强县（市）的自主创新能力，促进县（市）科学发展，加快经济发展方式转变。
（二）基本原则
1．政府主导，社会参与
深入实施科教兴国战略和人才强国战略，认真落实《科技进步法》，促进科技兴县（市）工作的规范化、制度化、法制化。加强政府各部门之间的统筹协调，注重通过加大财政投入、强化激励机制等多种措施为科技兴县（市）工作创造良好政策环境。广泛动员企业、社会组织等社会各界积极参与科技兴县（市）工作，加快区域创新体系建设。
2．因地制宜，分类指导
实施主体功能区战略，加强分类指导和示范带动，鼓励各县（市）立足实际，因地制宜地开展科技工作，探索适应不同经济社会和科技发展水平、各具特色的科技兴县（市）工作新思路，加强经验总结和交流，促进东部率先发展、中部快速崛起、西部跨越发展和东北老工业基地振兴。
3．突出重点，注重实效
