农村合作金融机构应指定专人或机构负责推进股权改造工作，健全股权转换规章制度，实行有利于投资股的制度安排。全额持有投资股的股东在享受本机构提供的服务时应当享有优于资格股的股东权利；股东所持投资股的每一股份享有一个表决权，所持全部资格股只享有一个表决权；投资股的分红比例应高于资格股的分红比例。
（四）资格股转换的操作程序
农村合作金融机构应按照本指导意见明确的要求，在充分征求股东意见的基础上制定股权转换方案，经律师事务所出具法律意见书后，至少应经参加股东（代表）大会股东所持表决权的二分之一以上通过，并采取适当方式公告。农村合作金融机构股权转换方案应呈报属地监管机构受理、审查并决定，报上级银行业监管机构备案；以组建农村商业银行和股份制农村信用联社方式实施股权转换的，按照现行审批权限实施行政许可；农村合作银行改制为农村商业银行具体事项由银监会授权属地银监局审批。
三、着力打造科学规范的股权结构
（一）股权优化总体要求
在保护中小股东合法权益的前提下，农村合作金融机构要积极引导股权向法人股东集中，逐步形成以法人股东为主体，具有一定数量主业突出、治理良好、利益独立的主要股东的股东结构。2015年底前，地（市）及城区机构法人股平均比例应高于50%，县域机构平均比例应高于35%，单家机构一般应有3至5家持股比例5%以上的股东。要全面推行建立股权委托代理制度，防止大股东和内部人控制。
（二）强化增资扩股管理
农村合作金融机构增资扩股时，要以法人股东为主，积极引进境内外战略投资者，重点向农业产业化龙头企业和农民专业合作社等涉农企业倾斜。除经济欠发达地区的机构外，不得再增扩新的自然人股东。要结合当地经济发展水平，适当提高股东最低入股起点，新增单一自然人股东持股比例不得低于增资扩股后股本总额的5‰，新增单一法人股东不得低于1%。
（三）积极引导股权有序流转
农村合作金融机构应当确立正向的股权流转方向，促进股权适度向法人集中，重点引导优质法人股东收购自然人股权。农村合作金融机构应提供股权转让意向信息服务，公布与股份价值相关的财务信息，制作统一书面转让协议格式文本；要对股权转让行为中的股权受让方资格、股权转让后股权结构、股权转让手续和协议的合法合规性进行审查；要按规定将大额股权转让报银行业监管机构审批或备案。
