第四条 专项资金管理按照公开、公平、公正原则，接受社会监督。
第二章 专项资金分配原则和标准
第五条 专项资金分配采取“集中支持”和“整体推进”两种方式。集中支持是指对重点流域县及重点镇污水管网建设集中支持，区域推进，干一个，完一个。整体推进是指对集中支持以外的其他地区污水管网建设实行以奖代补。
本办法所称重点流域包括淮河、海河、辽河、太湖、巢湖、滇池等三河三湖以及南水北调、松花江、三峡库区、长江中下游、环渤海和黄河中上游等重点流域和重要水源地。
本办法所称县包括县级市、县城、成建制撤县改区的市辖区以及远郊区县。
第六条 专项资金年度规模中，用于集中支持和整体推进的切块比例，根据年度建设任务由财政部商住房城乡建设部确定。
第七条 对集中支持地区县及重点镇污水管网建设，专项资金按“十二五”建设任务量和控制投资额予以补助，区分东部、中部和西部地区，分别补助控制投资额的40%、60%和80%。控制投资额根据“十二五”建设任务量和核定的单位控制建设成本计算确定。
集中支持地区“十二五”建设任务量包括“十二五”期间新建和在建污水管网项目。污水管网建设成本主要包括污水管道、污水泵站等工程建设费用支出，不包括征地拆迁成本。
第八条 中央财政根据年度专项资金规模和轻重缓急原则，对集中支持地区滚动安排，逐批销号。
第九条 对整体推进地区污水管网建设，专项资金根据住房和城乡建设部核定的各省上年新增污水处理能力、上年新增污水处理量、上年污水处理设施运行新增COD（化学需氧量）等主要污染物削减量实行以奖代补。根据地方财力、集中支持地区分布和污水管网建设需求情况，区分东部、中部和西部地区分别核定以奖代补资金。
整体推进专项资金计算公式：
某省整体推进专项资金＝年度整体推进资金总规模×[20%×该省上年实际新增污水处理能力/∑各省上年实际新增污水处理能力＋30%×该省上年实际新增污水处理量/∑各省上年实际新增污水处理量＋50%×该省上年主要污染物实际削减量/∑各省上年主要污染物实际削减量]
