各省、市、县级海监机构负责本辖区内的海洋环保执法工作。
中国海监各保护区海监机构负责本保护区内的海洋环保执法工作。
根据工作需要，上级海监机构可以指定下级海监机构开展特定海域的海洋环保执法工作。
二、层级管理
中国海监各级机构开展海洋环保执法工作实行层级管理制度。各级海监机构层级管理如下：
中国海监总队负责全国海洋环保执法工作的领导和监督检查，制定全国海洋环保执法工作的方针政策，组织重大的海洋环保执法行动，办理有必要由中国海监总队直接查处的案件。
中国海监各海区总队负责组织协调和监督指导本辖区内各级海监机构的海洋环保执法工作，组织开展本辖区内的重大海洋环保执法行动。负责本辖区内海洋油气勘探开发执法检查；负责由国家海洋行政主管部门核准环评的海洋工程的执法检查；负责由国家海洋行政主管部门批准的100万方以上的海洋倾废活动的执法检查；负责港、澳和涉外的海洋倾废活动的执法检查；对国家级海洋自然保护区和特别保护区的开发活动实施执法检查。有权查处各类海洋环境违法案件。
中国海监各海区总队所属支队根据海区总队的分工，负责本辖区内的海洋环保执法检查和案件查处工作，对省、市、县级海监机构的海洋环保执法工作进行监督。
省、市、县级海监机构负责本辖区的海洋环保执法工作，制定本辖区内海洋环保执法工作的规划和计划，组织本辖区内海洋环保执法检查和违法案件的查处工作。省级海监机构负责由本省海洋行政主管部门核准环评的海洋工程的执法检查；负责由本省海洋行政主管部门批准的100万方以下的海洋倾废活动的执法检查；与保护区海监机构共同负责国家级海洋自然保护区和特别保护区的执法检查；负责本辖区入海排污口的监督检查。查处除明确规定由海区总队管辖外的各类海洋环境违法案件。
地方级海洋自然保护区和特别保护区的海洋环保执法检查和案件查处工作由保护区海监机构和设立保护区的海洋行政主管部门所属的海监机构共同负责。
必要时，中国海监各级机构可以根据需要，按照效率和就近管理的原则，指定下级海监机构实施监督检查和案件查处工作。
三、检查内容
中国海监依法对海洋保护区、海洋工程、海洋倾废、海洋油气勘探开发、入海排污口等领域进行海洋环境保护监督检查。检查内容如下：
