显微镜检查：检查器官、组织病变情况。
4.3.1.3 快速试剂盒检查。应采用经农业部批准的病原快速检测试剂盒进行检测。
4.3.1.4 水质环境检查。必要时，对养殖环境进行调查，对水温、溶解氧、酸碱度、氨氮、亚硝酸盐、化学耗氧量等理化指标进行测定。
4.4.2 检查主要内容
4.4.2.1 群体检查
群体活力旺盛，逃避或反抗反应明显，体色一致，外观正常，个体大小较均匀，摄食正常，通过随机抽样进行进一步临床症状和试剂盒检查。
群体中若有活力差、逃避反应弱、体色发红、发白，外观缺损、畸小、离群、厌食的个体，在排除处于蜕壳状态的情况下，优先选择前述表现的活体或濒死个体进行进一步临床症状和试剂盒检查。
4.4.2.2 个体检查
白斑综合征：活的或濒死对虾出现体色变红或暗红，在头胸甲出现白色斑点，肠胃无食物，头胸甲易剥离，虾体瘦软，血淋巴不凝固。怀疑感染白斑综合征。
桃拉综合征：凡纳对虾出现体表淡红，尾扇和游泳足呈明显的红色，游泳足或尾足边缘上皮呈灶性坏死，甲壳下上皮出现多处随机、不规则的、黑色沉着性病灶。怀疑感染桃拉综合征。
传染性肌肉坏死病：凡纳对虾出现体色发白，腹节发红，尾部肌肉组织呈点状或扩散的坏死症状，体表有不规则黑斑。怀疑感染传染性肌肉坏死病。
罗氏沼虾白尾病：罗氏沼虾腹部肌肉出现白色或乳白色混浊块。怀疑感染罗氏沼虾白尾病。
河蟹颤抖病：中华绒螯蟹反应迟钝、行动迟缓，螯足握力减弱，摄食不积极，鳃丝呈浅棕色或黑色、排列不整齐，步足颤抖、爪尖着地，腹部悬离地面，伴有血淋巴液稀薄，凝固缓慢或不凝固。怀疑感染河蟹颤抖病。
4.4.2.3 快速试剂盒检查
按照病原快速检测试剂盒说明书进行采样和现场快速检测，样品出现试剂盒所指示的阳性反应，怀疑存在相应疫病病原。
4.4.3 临床健康检查判定
在群体和个体检查中均正常，临床健康检查合格。
在群体或个体检查中发现疫病临床症状的，临床健康检查不合格。
4.5 实验室检测
4.5.1 对怀疑患有白斑综合征、传染性肌肉坏死病及临床检查发现其他异常情况的，应按相应疫病诊断技术规范进行实验室检测，所需样品的采集应按《水生动物产地检疫采样技术规范》（SC/T 7103-2008）的要求进行。
4.5.2 跨省、自治区、直辖市运输的甲壳类的，按照《水生动物产地检疫采样技术规范》（SC/T 7103-2008）采样送实验室检测。但以下情况除外：（1）已纳入国家或省级水生动物疫病监测计划，过去2年内无本规程规定疫病的；（2）群体和个体检查均正常，现场采用经农业部批准的核酸扩增技术快速试剂盒进行检测，结果为阴性的。
4.5.3 实验室检测须由省级渔业主管部门指定的具有资质的水生动物疫病诊断实验室承担，并出具相应的检测报告。
5. 检疫结果处理
5.1 经检疫合格的，出具《动物检疫合格证明》。
