各省、自治区、直辖市人民政府成立了集贸市场专项整治工作领导小组，结合本地实际制定了整治方案，确定了整治的重点地区和重点市场名单。全国共确定201个重点地区和504个重点市场。各地由领导挂帅，一级抓一级，层层抓落实。
（二）突出重点，全面整治
一是全面清理集贸市场经营主体。经各地调查摸底和统计，全国共有集贸市场73265个。据3、4、5三个月的统计，全国共清理各类市场48520个，取缔销售假冒伪劣商品摊位36424个，取缔无照经营63594户，查封假冒伪劣窝点1084个。
二是组织开展集贸市场打假专项执法行动。各地以食品、农资为重点，集中开展打假专项执法行动。截止5月底，全国工商行政管理机关共查处假冒伪劣食品和农资案件24368件，查获假冒伪劣食品5047吨、种子61052吨、化肥206531吨、农药5272吨等。卫生、质检、药监等部门也分别以查处假冒伪劣食品、计量器具、药材为重点，组织开展了多次集贸市场专项执法行动。
三是集中力量查处一批大案要案。3至5月，全国工商行政管理机关共查处各类违法案件52396件，案值5.4亿元。移送司法机关追究刑事责任案件95件、犯罪嫌疑人308人。卫生、税务、质检、药监等部门也集中力量，依法查处了一批大案要案。
四是坚决清除执法壁垒，严厉打击欺行霸市行为。山东、河北、江苏、黑龙江等地对涉嫌地方保护、实行“封闭式”管理的市场逐一进行排查，撤销了一批实施地方保护的“市场管理委员会”或“市场综合管理办公室”。各地公安机关确定了500多个重点整治的市场和一批重点案件，对抗拒执法、欺行霸市、盗抢财物和制假售假活动进行了坚决打击，有力地维护了市场秩序，净化了市场环境。
（三）标本兼治，注重治本
各地针对集贸市场专项整治中发现的问题，坚持标本兼治、注重治本的方针，边整治，边规范，促进集贸市场健康发展。
一是探索建立重要商品监管和准入制度。各地以肉类、蔬菜等与人民群众生活密切相关的商品为重点，积极探索行之有效的市场监管措施。北京市实行了集贸市场鲜肉“场厂挂钩”制度。济南市推出了肉类市场定点销售等十项管理措施。福州市正在进行农贸市场改超市的试点工作。
二是制订修改集贸市场监管法规。国家工商总局正在组织力量，起草集贸市场规范管理的行政规章。福建、内蒙、新疆等省区结合集贸市场专项整治中发现的新情况、新问题，也在积极着手修订集贸市场管理的地方性法规。此外，国家质检总局还颁布了《
集贸市场计量监督管理办法》。
