我们应该清醒认识到，与国际国内形势发展的客观需要相比，专利行政执法领域仍然存在一些问题和不足，主要包括以下四个方面：
首先是认识不足。长期以来，社会上一直存在专利行政保护应当强化还是弱化甚至取消的不同观点，并影响到了不同层面的执法决策与行动。对这种弱化或取消专利行政执法的观点需要引起重视。如果任由这种观点蔓延，不仅将影响到执法工作本身，也会影响到专利制度的正常运行、我国经济发展方式的加快转变与创新环境的不断改善。
其次是手段不强。经我局与有关各界的多方努力，在上次
专利法修改中，加大了地方知识产权局查处假冒专利行为的处罚力度，同时赋予了相应的执法手段，但是对故意侵权、重复侵权、群体侵权等较为严重的专利侵权行为的调查取证和行政查处手段仍然不足。
再者是机构不全。在专利行政诉讼中，因机构设置和认识方面的原因，一些地方局同志担心做行政被告。在执法机构设置方面，部分省级知识产权局和大部分地级局没有设立专门的执法处室（科室），执法职能由其他业务处室兼任。地方局受机构调整、人员调动等因素影响，执法队伍不稳定的情况日益突出。
还有是投入不足。目前，财政部立项的全国专利执法专项经费，对于推动执法工作的开展起到了积极作用，但远不能满足执法工作的需要。大部分地方财政没有设立专利执法专项经费，各地知识产权局执法设备缺乏，多数省份没有配备执法车，这种问题在中西部地区尤其突出，在很大程度上影响了执法工作的开展。
对于专利行政执法中存在的困难和问题，我们全系统必须高度重视，首先要解决认识问题。为此，应从以下几方面切实提高对加强知识产权行政执法重要性的认识。
一是加大知识产权行政执法力度，是推动经济发展方式转变的客观需要。保护知识产权，就是保护创新，就是保护先进生产力。只有知识产权保护包括知识产权行政执法到位了，才能切实激励发明创造，促进创新与发展，形成保护、创新、发展的良性循环。加大知识产权行政执法力度，有利于提高市场主体创新积极性，促进有序竞争，深化改革开放，完善社会主义市场经济体制；有利于履行各项承诺，进一步提升我国国际形象，吸引境外先进技术和优秀人才，实现互利共赢，营造和平发展的良好环境；有利于促进我国经济由要素驱动向创新驱动转变，提高我国创新能力和国家竞争力，推动经济发展方式转变。
二是加大知识产权行政执法力度，是保障知识产权制度健康有序运行的客观需要。知识产权制度的直接功能，是国家通过承诺对知识产权进行有效保护来换取知识产权信息的公开。知识产权权利人申请知识产权并缴纳有关费用，其目的是以信息公开来获得国家以公权力保障的知识产权，这里的公权力既包括立法权，也包括行政权与司法权。对依法审批授予的知识产权，政府应当承担一定的保护职责。这关系到政府的公信力，也是保障知识产权制度有效运行的基本需要。近年来，随着信息技术的快速发展，知识产权信息的传播越来越快捷、广泛，侵权假冒产品的制造水平越来越高、扩散速度越来越快，权利人本人很难发现自己的权利被侵犯，在这种情况下，仅靠不告不理的司法方式无法有效保护权利人的合法权益。知识产权行政执法因其具有主动、简便、快捷的优势，不仅不应当弱化，而且应当逐步加强。近年来，各国政府部门都在以有效的方式加大知识产权执法保护的力度。
