根据财政部党组关于深入贯彻落实科学发展观，着力推进财政科学化精细化管理的总体要求，结合基层单位财政管理现状，专员办开展基层单位综合财政监管的指导思想和总体目标是：以全面推进财政科学化精细化管理的要求为指导，发挥专员办就地监管的优势，充分利用现代信息技术，转变监管理念，调整监管方式，统筹兼顾、内外推进、先行试点、分步实施，逐步构建与财政部机构设置特点相适应的“分级管理、权责明确、规范透明、相互制衡、运转高效”的基层单位综合财政监管机制。
三、基本原则
（一）监管与服务相结合。按照不改变中央部门管理权限、不扩大专员办行政审批范围、不增加基层单位负担的基本要求，通过开展综合财政监管，有针对性地指导基层单位提高预算、资产、财务和会计管理水平，及时向财政部反映基层单位执行财政政策过程中急需解决的问题，提出完善财政政策的意见和建议。
（二）综合监管机制与信息技术相结合。充分依托信息技术，通过采集监管信息、分析预警，实现动态监管，提高监管的时效性，促进财政监督由突击性专项检查向常态化、规范化监管转变。
（三）预算、资产、财务、会计监管相结合。在全面掌握基层单位财政管理信息的基础上，促进预算、资产、财务和会计监管的相互衔接、互为补充。
（四）非现场监管与现场检查相结合。进一步规范专员办财政管理行为，建立标准化的日常管理信息分析、利用流程，提高现场检查的针对性和有效性。
四、主要内容
（一）监管方式。探索建立非现场监管和现场检查相结合的监管方式，通过非现场监管实现对基层单位监管范围的全覆盖，通过现场检查突出监管的重点。
1.建立财政监管信息采集机制。充分利用现代化信息技术，通过利用金财工程数据、共享其他监管机构信息、基层单位报备以及实时监测等，及时掌握基层单位预算、资产和财务会计管理等财政管理信息。
2.注重对各类财政监管信息的综合分析。专员办通过综合运用年度对比分析、单位比较分析和财政管理事项的关联分析等方法，对采集的有关数据、信息进行分析，及时发现存在的问题，并对基层单位政策执行情况进行评价。
3.指导基层单位规范财务管理。专员办通过约谈、走访和调研等方式，进一步了解非现场监管发现的问题，并针对问题的不同情况，指导基层单位规范财务管理，或及时反映上报财政部。
