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15.徽水河特有鱼类国家级水产种质资源保护区
徽水河特有鱼类国家级水产种质资源保护区总面积679.6公顷，其中核心区面积288.2公顷，实验区面积391.4公顷。特别保护期为4月1日-10月31日。保护区位于安徽省旌德县徽水河及其12条支流，由26个拐点沿河道方向顺次连线所围区域。核心区是徽水河干流，从旌德县版书乡分界山（118°30′40"E，30°12′58"N）至旌德县三溪镇榔坑村高溪（118°24′30"E，30°25′41"N），全长39.4公里，面积288.2公顷。徽水河的12条支流为实验区，其中白沙河：从旌阳镇白沙村（118°34′35"E，30°14′41"N）至旌阳镇瑞市村（118°32′08"E，30°17′44"N），全长10.7公里，面积24.7公顷；板桥河：从旌阳镇板桥村赵川（118°36′29"E，30°18′46"N）至旌阳镇孙家边（118°32′31"E，30°17′01"N），全长17.2公里，面积21.1公顷；华丰河：从旌阳镇凫秀村岗山（118°35′08"E，30°19′ 47"N）至蔡家桥镇登云桥（118°29′48"E，30°19′55"N），全长16.4公里，面积17.6公顷；湾里河：从旌阳镇凫山（118°34′48"E，30°20′53"N）至旌阳镇华丰村（118°31′52"E，30°19′27"N），全长8.2公里，面积8.7公顷；龙川河：从旌阳镇龙川村牛山（118°28′19"E，30°16′39"N）至蔡家桥镇登云桥（118°29′41"E，30°20′01"N），全长17.7公里，面积23.7公顷；大溪河：从蔡家桥镇华川（118°33′52"E，30°22′53"N）至蔡家桥镇朱庆（118°28′03"E，30°20′48"N），全长16.8公里，面积46.3公顷；玉溪河：从版书乡模范村黄高峰（118°27′05"E，30°13′ 07"N）至三溪镇河西（118°24′43"E，30°22′21"N），全长29.6公里，面积101.2公顷；龙山河：从三溪镇礼芳龙头山（118°21′02"E，30°23′38"N）至三溪镇霍家桥（118°23′39"E，30°21′09"N），全长13.2公里，面积21.8公顷；兴隆河：从兴隆乡里塘（118°19′37"E，30°18′36"N）至三溪镇霍家桥（118°23′29"E，30°20′57"N），全长17.2公里，面积42.3公顷；大麻石河：从兴隆乡湖田大麻石（118°19′21"E，30°22′ 56"N）山至兴隆乡段村（118°19′57"E，30°21′10"N），全长5公里，面积12.3公顷；四麻河：从孙村乡四麻厂（118°20′33"E，30°18′07"N）至三溪镇霍家桥坎上（118°23′52"E，30°20′11"N），全长19.2公里，面积23.8公顷；庙首河：从庙首镇练山村马家溪（118°24′05"E，30°14′09"N）至孙村乡玉屏村民心洞（118°23′56"E，30°16′52"N），全长14.7公里，面积31.7公顷。主要保护对象为乌龟、中华鳖，其他保护物种包括光唇鱼、黄鳝、泥鳅、黄颡鱼等。
16.长江安庆段四大家鱼国家级水产种质资源保护区
长江安庆段四大家鱼国家级水产种质资源保护区总面积3800公顷，其中核心区面积2800公顷，实验区面积1000公顷。特别保护期为3月1日-7月31日。保护区位安徽省宿松县和望江县，具体为宿松县小孤山渡口至望江县雷池闸50公里江段，范围在东经116°32′15″-116°49′14″，北纬29°54′39″-30°08′28″之间。其长江北岸拐点是：小孤山渡口（116°32′15″E，29°54′39″N）-沙坡-杨林-王营-杨湾闸-关帝庙-磨盘-华阳闸-陶富-雷池闸（116°49′14″E，30°08′28″N），其长江南岸拐点坐标为：（116°32′27″E，29°54′27″N；116°33′22″E，29°56′40″N；116°34′01″E，29°58′24″N；116°34′35″E，30°00′42″N；116°36′12″E，30°03′22″N；116°36′55″E，30°03′49″N；116°39′46″E，30°04′26″N； 116°41′39″E，30°03′44″N；116°43′37″E，30°03′04″N；116°45′56″E，30°04′36″N；116°49′47″E，30°08′00″N）。核心区位于宿松县杨林闸至望江县华阳闸，范围在东经116°33′11″-116°45′41″，北纬29°58′17″-30°04′56″之间。实验区位于宿松县小孤山渡口至杨林闸和望江县华阳闸至雷池闸两江段。主要保护对象为青鱼、草鱼、鲢、鳙“四大家鱼”，其它保护对象包括大口鲇、长吻鮠、鳜、黄颡鱼、刀鲚、江黄颡、翘嘴鲌等。
17.阊江特有鱼类国家级水产种质资源保护区
阊江特有鱼类国家级水产种质资源保护区总面积2000公顷，其中核心区面积600公顷，实验区面积1400公顷。特别保护期为4月1日-8月31日。保护区位于安徽省祁门县，河流长度104公里，范围在东经117°27′7.75″-117°43′28.34″，北纬29°41′13.70″-29°56′21.85″之间，包括：阊江干流-南宁河从祁山镇双河口至芦溪乡倒湖段，阊江支流-大北水从历口镇环砂至芦溪乡倒湖段。保护区内设三个核心区，河道长18公里，分别为芦溪倒湖核心区、塔坊候潭核心区和历口环砂核心区。芦溪倒湖核心区长15公里，面积545公顷，从倒湖左右岸（117°27′7.75″E， 29°41′14.61″N；117°27′11.15″E，29°41′13.70″N）连线，沿大北水上溯5公里至南溪（117°28′12.12″E，29°43′30.06″N；117°28′09.31″E， 29°43′32.52″N）连线，沿南宁河上溯10公里至芦溪（117°30′19.71″E，29°42′12.55″N；117°30′16.62″E，29°42′13.89″N）两点连线间大北水、南宁河河流；塔坊候潭核心区长2公里，面积45公顷，从塔坊候潭深水潭上下（117°40′22.63″E，29°48′26.76″N；117°40′24.82″E，29°48′26.60″N）两点连线至（117°39′46.32″E，29°47′50.05″N；117°39′48.41″E，29°47′49.03″N）两点连线间南宁河河流；历口环砂核心区长1公里，面积10公顷，从环砂拦河坝下（117°30′35.74″E，29°56′2.41″N；117°30′36.71″E，29°56′01.90″N）两点连线至两河口（117°30′57.99″E，29°56′21.85″N；117°30′59.40″E，29°56′21.79″N）两点连线间大北水河流。保护区除核心区以外均设为实验区。分别为大北水环砂（117°30′35.74″E，29°56′02.41″N；117°30′36.71″E，29°56′01.90″N）两点连线至南溪（117°28′12.12″E，29°43′30.06″N； 117°28′09.31″E，29°43′32.52″N）两点连线段河流，长42公里，面积510公顷；南宁河双河口（117°43′26.81″E，29°52′29.09″N；117°43′28.34″E，29°52′24.94″N）两点连线至侯潭（117°40′22.63″E，29°48′26.76″N；117°40′24.82″E，29°48′26.60″N）两点连线段河流，长12公里，面积220公顷；侯潭（117°39′46.32″E，29°47′50.05″N；117°39′28.41″E，29°47′49.03″N）两点连线至芦溪段（117°30′19.71″E，29°42′12.55″N；117°30′16.62″E，29°42′13.89″N）两点连线段河流，长32公里，面积670公顷。主要保护对象为光倒刺鲃、光唇鱼，其他保护对象包括花鱼骨、黄颡鱼、吻鮈、伍氏华鳊、沙塘鱧等。
18.城西湖国家级水产种质资源保护区
城西湖国家级水产种质资源保护区总面积1333.33公顷，其中核心区面积333.33公顷，实验区面积1000公顷。特别保护期为5月1日-6月30日。保护区位于安徽省霍邱县城西湖上游中段，范围在东经116°10′-116°17′、北纬32°16′-32°19′之间。保护区核心区由7个拐点组成，由三里涧新桥（116°14′33″E， 32°19′39″N）经古沣河桥桥墩遗址（116°13′21″E，32°19′13″N）至沣河桥（116°12′03″E，32°19′05″N），由沣河桥经拐点（116°11′58″E， 32°18′49″N）至郝家湖（116°12′05″E，32°18′28″N），郝家湖往东至箭杆湖西坝口（116°13′34″E，32°18′29″N），再由箭杆湖西坝口至三里涧新桥。保护区的实验区由9个拐点组成，拐点坐标分别为（116°12′05″E，32°18′28″N）、（116°11′45″E，32°17′45″N）、（116°11′21″E，32°17′46″N）、（116°11′17″E，32°16′30″N）、（116°10′07″E，32°16′51″N）、（116°12′17″E，32°16′52″N）、（116°12′36″E，32°17′06″N）、（116°13′26″E，32°17′43″N）、（116°13′34″E，32°18′29″N）。保护区主要保护对象为青虾，其他保护物种包括秀丽白虾、鲫鱼、鲤鱼、河蚬、中华绒螯蟹、中华鳖、草鱼等。
19.萍水河特有鱼类国家级水产种质资源保护区
萍水河特有鱼类国家级水产种质资源保护区总面积8500公顷，其中核心区面积3300公顷，实验区面积5200公顷。特别保护期为3月20日-6月30日。保护区位于江西省萍乡市境内的萍水河及其主要支流，范围在东源乡蔡家里（113°56′51"E，27°47′55"N）、赤山镇泉陂村（113°58′53"E，27°43′40"N）、南坑镇龙树（114°00′00"E，27°29′24"N）、六市乡河江村（113°55′26"E，27°23′20"N）、老关镇陂头洲（113°39′17"E，27°40′09"N）之间。核心区有两处，第一处由以下12个主要拐点沿河道方向顺次连线所围的水域（含主讯期漫滩）和部分陆地：六市乡河江背 （113°56′12"E，27°24′27"N）- 河江村（113°55′26"E， 27°23′20"N） -白竺乡下江边（113°53′41"E，27°23′27"N）-大江边（113°51′27"E，27°27′16"N）-麻山镇桃源村（113°48′59"E，27°31′59"N）-黄家坊（113°47′49"E，27°32′40"N）-幸福垄（113°48′54"E，27°33′03"N）-白竺乡源头村（113°49′40"E，27°31′04"N）-会双（113°50′45"E，27°29′59"N）- 清潭 （113°51′56"E，27°26′07"N）-长丰乡黄土仑（113°54′00"E，27°26′32"N）-六市乡六市村（113°54′39"E，27°22′53"N）。第二处由以下5个主要拐点沿河道方向顺次连线所围的水域（含主讯期漫滩）和部分陆地：南坑镇龙树（114°00′00"E，27°29′24"N）-坪村（113°58′52"E，27°29′37"N）-湖斗（113°55′57"E，27°31′17"N）-横江村（113°56′22"E，27°31′37"N）-窑背冲（113°57′26"E，27°30′37"N）。实验区由以下25个主要拐点沿河道方向顺次连线所围的水域（含主讯期漫滩）和部分陆地：东源乡蔡家里 （113°56′51"E，27°47′55"N）-赤山镇圳前（113°54′13"E，27°42′08"N）-巨陂岭（113°56′05"E，27°41′26"N）-天堂村（113°58′30"E，27°44′33"N）- 泉陂村（113°58′53"E，27°43′40"N） -担米岭（113°57′44"E，27°42′01"N）-周江边（113°53′14"E，27°41′43"N）-石龙陂（113°50′31"E，27°40′18"N）-北桥桥东（113°51′22"E，27°37′36"N）-长潭（113°50′52"E，27°35′51"N）-南坑镇湖斗（113°55′57"E，27°31′17"N）-双凤（113°53′27"E， 27°33′45"N）-双河口（113°50′23"E，27°35′07"N）-刘家洲（113°47′34"E，27°33′12"N）-黄家坊（113°47′49"E，27°32′40"N） - 麻山镇江口村（113°46′50"E，27°34′55"N）-湘东镇砚田村 （113°44′20"E，27°38′18"N）-老关镇陂头洲（113°39′17"E， 27°40′09"N）-许家洲（113°41′44"E，27°39′38"N）-沙棚里（113°45′08"E，27°35′49"N）-麻山镇诗源村（113°47′16"E， 27°34′57"N）-萍实桥（113°51′06"E，27°37′04"N）-绞水潭（113°50′37"E，27°39′29"N）-车水桥（113°53′18"E，27°41′27"N）-东源乡黄家里（113°55′35"E，27°43′53"N）。主要保护对象为黄尾密鲴，其他保护对象有细鳞斜颌鲴、黄颡鱼、鲤、鲫等。
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