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7.海浪河特有鱼类国家级水产种质资源保护区
海浪河特有鱼类国家级水产种质资源保护区总面积612公顷，其中核心区面积261公顷，实验区面积351公顷。特别保护期为4月20日-10月31日。保护区位于黑龙江省海林市长汀镇境内的海浪河河段，距长汀镇4公里，距海林市60公里，范围在东经128°8′20″-128°53′35″，北纬44°15′55″-44°29′25″之间。核心区位于海浪河长汀段中段水域，从太平沟（ 128°25′40″E， 44°18′32″N）至青坪（128°40′10″E，44°26′50″N），长58公里。实验区位于海浪河长汀段上下段水域，总长78公里，其中实验区上段水域，从火炬站（128°8′20″E，44°15′55″N）至太平沟（128°25′40″E，44°18′32″N） ，长48公里，面积216公顷；实验区下段水域，从青坪（128°40′10″E，44°26′50″N）至长汀朝鲜屯（128°53′35″E，44°29′25″N），长30公里，面积135公顷。主要保护对象为黑龙江茴鱼、细鳞鱼，其他保护对象包括雅罗鱼、哲罗鱼、江鳕、唇鱼骨、黄颡鱼、雷氏七鳃鳗、泥鳅等。
8.骆马湖国家级水产种质资源保护区
骆马湖国家级水产种质资源保护区总面积3160公顷，其中核心区面积1000公顷，实验区面积2160公顷。特别保护期为全年。保护区位于江苏省宿迁市、新沂市交界处骆马湖三场附近水域，范围在东经118°08′54″―118°13′56″，北纬34°05′46″―34°08′40″之间，四至范围拐点坐标为：东北（118°13′09"E，34°08′40"N），东南（118°13′56"E，34°06′15"N），西南（118°09′17"E ，34°05′56"N），西北（118°08′54"E，34°08′14"N）。核心区位于骆马湖北繁殖保护区，北从新场东200米处向南延伸2877米至三场，东从三场向西延伸4398米至西吴宅东300米处，南由西吴宅东300米处向东北延伸3287米至马场东500米处，西由马场东500米处向东延伸2567米至新场东200米处，四至范围拐点坐标分别为：东北（118 °12′25"E，34°08′07"N），东南（118°12′56"E ，34°06′37"N），西南（118°10′07"E，34°06′13"N），西北（118°10′46"E ，34°07′55"N）。保护区内除核心区以外的水域为实验区。主要保护对象是鲤鱼和鲫鱼，其他保护对象包括黄颡鱼、红鳍鲌、翘嘴鲌、沙塘鳢、鳜鱼、乌鳢、青虾、螺、蚬等。
9.滆湖国家级水产种质资源保护区
滆湖国家级水产种质资源保护区总面积2700公顷，其中核心区面积404公顷，实验区面积2296公顷。特别保护期为全年。保护区位于江苏省常州市滆湖湖心至东岸区域，范围在东经119°47′23″-119°52′10″，北纬31°37′26″-31°33′41″之间。核心区是由以下6个拐点沿湖湾顺次连线所围的湖区水域，拐点坐标分别为（119°51′12"E，31°36′11"N；119°52′10"E，31°35′40"N；119°52′04"E，31°35′12"N；119°51′35"E，31°35′30"N；119°50′50"E，31°34′34"N；119°50′10"E，31°34′49"N）。实验区范围为以下4个拐点顺次连线所围的水域（湖岸以西至湖中心），拐点坐标分别为（119°51′12"E，31°36′11"N；119°50′10"E，31°33′41"N；119°47′23"E，31°34′33"N；119°48′26"E，31°37′26"N）。主要保护对象为黄颡鱼、青虾、蒙古鲌、翘嘴鲌、鲫鱼和乌鳢，其他保护对象有青鱼、草鱼、鲢、鳙、团头鲂、鱤、三角帆蚌、芦苇、莲藕、芡实、菱等。
10.长荡湖国家级水产种质资源保护区
长荡湖国家级水产种质资源保护区总面积2500公顷，其中核心区面积1000公顷，实验区面积1500公顷。特别保护期为全年。保护区位于江苏省金坛、溧阳两市境内，集中在长荡湖中心湖区，范围在东经119°30′49"-119°32′39"，北纬31°34′47"-31°39′01"之间。保护区陆地东起金坛市儒林镇湖头港口，向南至大培山上新河港为折点，向西南延伸至指前镇后渎港为折点，向西经庄阳港、清水渎港至金城镇大浦港为折点，向北经新河港、方陆港、温洛港、新开河港，以儒林镇下汤港为折点，向东南延伸至燕子港。核心区拐点坐标分别为：（119°32′39"E，31°38′06"N；119°34′03"E，31°37′26"N；119°32′00"E，31°35′17"N；119°31′11"E，31°35′31"N）。实验区拐点坐标分别为：（119°32′12"E，31°38′30"N；119°34′21"E，31°39′01"N；119°34′49"E，31°37′29"N；119°31′38"E，31°34′47"N；119°30′49"E，31°35′09"N）。保护区主要保护对象为青虾，其他保护对象包括鲤鱼、鲫鱼、乌鳢、红鳍鲌、黄颡鱼、鳜鱼等。
11.邵伯湖国家级水产种质资源保护区
邵伯湖国家级水产种质资源保护区总面积4638公顷，其中核心区面积365公顷，实验区面积4273公顷。特别保护期为全年。保护区位于江苏省扬州市邗江区、江都市境内，范围在东经119°24′37″-119°29′14″，北纬32°31′25″-32°37′35″之间。保护区是由8个拐点顺次连线围成的区域，拐点分别为：东北方向自小六宝大塘（119°27′38″E，32°37′35″N）沿邵伯湖东堤向南-邵伯回管（119°29′34″E，32°32′23″N）向西南-花园庄（119°29′14″E，32°31′44″N）向西-下坝咀子（119°28′19″E，32°31′25″N）沿邵伯湖西堤向西北-张庄咀子（119°26′36″E，32°31′39″N）-李华凹子（119°26′21″E，32°32′01″N）沿邵伯湖西堤向北-连圩航空塔（119°24′37″E，32°37′01″N）向东北-邵伯湖王伙大航道（119°25′37″E，32°37′35″N）。核心区位于保护区的中南部，是由以下8个拐点顺次连线所围的水域，拐点坐标分别为（119°28′03″E，32°34′44″N；119°28′22″E，32°34′12″N；119°28′12″E，32°33′52″N；119°28′20″E，32°33′24″N；119°27′46″E，32°33′21″N；119°27′35″E，32°33′48″N；119°27′19″E，32°33′48″N；119°26′51″E，32°34′32″N）。保护区内除核心区以外的水域为实验区。主要保护对象为三角帆蚌，其他保护对象包括环棱螺、河蚬、褶纹冠蚌、无齿蚌、丽蚌等淡水贝类。
12.长漾湖国家级水产种质资源保护区
长漾湖国家级水产种质资源保护区总面积930公顷，其中核心区面积270公顷，实验区面积660公顷。特别保护期为全年。保护区位于江苏省吴江市境内，横跨平望、七都、震泽、横扇四镇，范围在东经120°29′14″-120°33′48″，北纬30°56′26″-31°00′18″之间。核心区是由10个拐点连线所围成的区域，拐点坐标分别为（120°31′32″E，30°57′17″N；120°31′14″E，30°57′19″N；120°30′43″E，30°57′34″N；120°30′21″E，30°57′55″N；120°30′44″E，30°58′34″N；120°31′03″E，30°58′39″N；120°31′18″E，30°58′26″N；120°31′24″E，30°58′15″N；120°31′33″E，30°57′53″N；120°31′44″E，30°57′28″N）。实验区包括二个区域，分别位于核心区的东面和西面。西实验区是由8个拐点连线所围成的区域，面积为213公顷，拐点坐标分别为（120°29′16″E，30°56′26″N；120°29′14″E， 30°57′02″N；120°29′30″E，30°57′44″N；120°29′43″E，30°57′54″N；120°30′20″E，30°57′55″N；120°30′42″E，30°57′34″N；120°30′42″E，30°57′23″N；120°29′40″E，30°57′43″N）。东实验区也是由8个拐点连线所围成的区域，面积为447公顷，拐点坐标分别为（120°31′23″E，30°58′15″N；120°31′18″E，30°58′26″N；120°31′19″E，30°58′42″N；120°32′17″E，30°59′39″N；120°33′09″E，31°00′18″N；120°33′48″E，30°59′15″N；120°32′53″E，30°58′47″N；120°31′41″E，30°58′06″N）。主要保护对象为蒙古鲌、花鱼骨，其它保护对象包括太湖银鱼、翘嘴鲌、秀丽白虾、青虾、鲤、鲫、鳊、青鱼、草鱼、鲢、鳙、黄颡鱼、沙鳢、中华绒螯蟹、中华鳖等。
13.千岛湖国家级水产种质资源保护区
千岛湖国家级水产种质资源保护区总面积6667公顷，其中核心区面积1000公顷，实验区面积5667公顷。特别保护期为全年。保护区地处浙江省杭州市淳安县境内千岛湖西北湖区，位于小金山大桥（118°56′22″E，29°37′13″N），蛟池拦网（118°43′42″E，29°43′28″N），梓桐码头（118°47′36″E，29°36′55″N），东方桥（118°48′42″E，29°44′35″N）之间。核心区包括梓桐核心区和宋村核心区两个区域，梓桐核心区由以下4个拐点沿河道（西南）方向顺次连线所围的水域：梓桐口（118°52′47″E，29°38′20″N）-西湖（118°50′56″E，29°37′43″N）-坑村（118°49′09″E，29°36′59″N）-练溪（118°47′46″E，29°37′11″N），面积435公顷；宋村核心区由以下5个拐点沿河道（西北）方向顺次连线所围的水域：樟树下（118°50′16″E，29°39′54″N）-上溪埠（118°51′16″E，29°40′05″N）-史里（118°51′24″E，29°40′56″N）-常锦里（118°51′53″E，29°41′12″N）-庙畈（118°52′34″E，29°41′39″N），面积565公顷。实验区范围为以下10个拐点沿西北方向顺次连线所围的水域：小金山桥（118°56′22″E，29°37′13″N）-牛石埠（118°55′49″E，29°39′28″N）-九里弯道（118°53′44″E，29°38′17″N）-梓桐口林场（118°53′01″E，29°38′49″N）-宋村口（118°50′55″E，29°39′59″N）-南浦大桥（118°49′26″E，29°39′52″N）-余家口（118°46′33″E，29°41′08″N）-威坪灯塔（118°46′17″E，29°42′03″N）-东方桥（118°48′42″E，29°44′35″N）-蛟池拦网（118°43′42″E，29°43′28″N）。主要保护对象为黄尾密鲴、细鳞斜颌鲴，其他保护对象包括翘嘴红鲌、蒙古红鲌、光唇鱼、唇鱼骨、大眼华鳊等。
14.东西苕溪国家级水产种质资源保护区
东西苕溪国家级水产种质资源保护区总面积1500公顷，其中核心区面积200公顷，实验区面积1300公顷。特别保护期为全年。保护区地处浙江省湖州市南太湖流域的东西苕溪，范围在东经119°45′-120°8′，北纬30°43′-30°56′之间，位于东苕溪青山水闸（120°4′E，30°43′N），西苕溪梅溪（119°45′E，30°47′N），新港口（120°8′E，30°56′N）之间。核心区由以下三个点所组成的水域：胥仓桥（119°56′E，30°52′N）至城北水闸（120°4′E，30°52′N），吴沈门水闸（120°7′E，30°47′N）至城北水闸（120°4′E，30°52′N）。实验区分为三块，实验一区为青山水闸（120°4′E，30°43′N）至吴沈门水闸（120°7′E，30°47′N），实验二区为梅溪（119°45′E，30°47′N）至胥仓桥（119°56′E，30°52′N），实验三区为城北水闸（120°6′E，30°52′N）至新港口（120°8′E，30°56′N）。主要保护对象是翘嘴鲌、青虾，其他保护对象包括鳜鱼、乌鳢、沙塘鳢、鳗、花鱼骨、莼菜，野菱和莲等。
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