五、合作指导部
（一）指导基层社改革，推动社有企业、农民专业合作社与“新网工程”的对接；
（二）做好中国供销合作社标识的规范、管理和推广工作，提升网络形象。
六、国际合作部
（一）推动“新网工程”建设中的对外及港、澳、台地区经济、贸易技术合作工作，推动“新网工程”龙头企业开拓国际市场，协调推动国际集中采购，为“新网工程”与国际市场对接提供服务；
（二）指导和支持有关“新网工程”的涉外引智培训工作，为引进国外资金、技术和管理经验等提供服务。
七、科技教育部
（一）根据“新网工程”建设规划和不同阶段的发展要求，搞好系统“新网工程”高层经营管理等急需人才培训，协调开展农产品经纪人和专业合作组织带头人等专业实用人才培训；
（二）围绕“新网工程”开展农产品认证、品牌与农业标准化示范基地建设，为“新网工程”建设提供技术支持；
（三）发挥科研院所优势，整合系统内外资源，为“新网工程”提供人才支撑。
八、社团管理部
（一）组织、指导总社主管社团参与“新网工程”建设行业发展的规划和网络标准制定工作；
（二）配合有关部门，做好主管社团“新网工程”项目申报工作，并督促、检查主管社团“新网工程”项目的实施进展情况；
（三）督促指导行业协会，组织引导企业会员参与“新网工程”建设。
九、棉麻局
（一）运用现代经营方式，整合优化棉麻企业现有经营网络，按照经济区建设棉花配送中心，实现棉麻加工和流通企业的低成本扩张和联合发展；
（二）配合有关部门做好“新网工程”棉麻建设项目的规划、工作方案的制定和实施。
十、农业生产资料局
（一）组织开展农资现代经营服务网络示范标准的制定工作，指导农资企业网络建设规范发展，促进农资网络标准化建设、规范化运营；
（二）配合有关部门做好“新网工程”农资建设项目的规划、工作方案的制定和实施。
十一、审计局
