第十三条 项目合同价款和协议经费预算，应根据实事求是的原则，按规定的表格和成本项目逐项如实计算，力戒高估冒算、宽打窄用。
第十四条 承担八六三计划任务的单位，应按规定的经费开支范围、标准进行项目成本核算。以一个课题项目或一个合同（协议）为一个成本核算对象，跨年度的项目，其成本核算对象要保持连续一致，未经批准，不得随意变更。
第十五条 项目结束后，项目负责人应会同单位财务部门抓紧清理帐目，核实拨款与支出数。正确计算项目实际成本，不得以估计成本、计划成本代替实际成本。
第十六条 项目成本以会计年度作为计算期，核算当年实际成本，据此编制决算报表，并于年度终了２０天内上报。
第五章 经费管理与监督
第十七条 专家委员会（组）按照有关规定，确定项目实行合同或协议管理，并根据公平、择优原则，选择项目承担单位，与其签订合同或协议。承担单位的项目负责人，应在本单位财务管理部门的指导下，按合同或协议的要求使用项目经费。
第十八条 实行合同管理的项目，其经费采用包干制，超支不补。项目完成后，要按科委、科工委有关八六三计划（项目）管理办法验收考核，在确认保质保量完成研究计划并经决算批复后，项目实际收益归承担单位所有。实际收益的一部分应用于从事八六三计划工作人员的劳务酬金。
第十九条 实行协议管理的项目，其经费使用一般不得突破经费预算。如遇特殊情况，需追加经费预算时，应按有关规定逐级申请报批。项目完成后，要按科委、科工委有关八六三计划（项目）管理办法验收考核，在确认保质保量完成研究计划并经决算批复后，其经费结余的６０％留给承担单位，其中一部分应作为劳务酬金（劳务酬金的最高限额不得超过协议经费预算扣除设备购置费后余额的１０％），根据贡献大小奖励从事八六三计划工作人员，其余４０％的结余经费，有后续任务的单位结转使用，冲抵下年度拨款；没有后续任务的单位，按拨款渠道上交，仍用于八六三计划。
第二十条 八六三计划经费购置的固定资产为国有资产，科委、科工委应按国家有关国有资产管理的规定，制定管理办法。各单位应按规定对固定资产建立帐簿，进行登记，加强管理。
