四、确定适宜的药物品种结构和数量
新农合报销药物目录应注意纳入品种的合理性，对可替代性强、品种丰富的同类药物要经相关专业学科专家论证后，合理选择纳入目录。要兼顾儿科等专科及罕见、少见疾病用药，做到基本种类齐全、结构合理。要根据不同级别目录确定合理的品种数量，县级新农合报销药物目录以800-1200种药物（含中药和民族药）为宜，乡级新农合报销药物目录原则上应控制在300-500种（含中药和民族药）。
五、规范目录格式
各省（区、市）应按照统一、规范的目录格式印发新农合报销药物目录。新农合报销药物目录包括目录、正文和附录三大部分。
目录部分是对新农合报销药物的详细分类及所在页码。
正文部分是对基本用药目录相关内容的具体反映，是目录的核心，分为西药部分、中成药部分（民族药）、饮片部分，介绍具体的西药和中成药（民族药）品种、剂型及对品种使用的限定等内容。中药饮片是介绍新农合可使用的饮片，可通过列举法或排除法进行明确。
附录部分为索引，便于检索查找药品，也可包括针对目录未尽事宜的一些补充意见。
新农合报销药物目录的化学药品和生物制品名称采用中文通用名称和英文国际非专利药名称（International Nonproprietary Names，INN）中表达的化学成分的部分，剂型单列；中成药采用药品通用名称；中药饮片有国家药品标准的，采用国家药品标准名称；没有国家药品标准的，采用地方中药饮片炮制规范收载的品种名称。
六、合理使用新农合报销药物目录
各省（区、市）应结合新农合筹资水平和报销药物目录，调整完善新农合统筹补偿方案。为保证国家基本药物制度的落实，新农合对国家基本药物目录内的药品报销比例要明显高于国家基本药物目录外药品，各省（区、市）应根据实际情况将报销比例差距保持在5%-10%。不同级别定点医疗机构应采用不同的报销比例，引导参合农民更多到基层定点医疗机构就医。
各省（区、市）应严格要求定点医疗机构执行相应的新农合报销药物目录，对目录内限制使用范围的药品，要细化支付审核标准。对新农合目录外用药，也要加强限制，确定使用比例。使用目录外药品应坚持患者签字认可制度。
