第六条 财政部会同农业部确定项目区年度良种补贴标准、补贴资金规模和补贴面积。农业部会同财政部下发年度良种补贴实施指导意见，内容包括指导思想、基本原则、实施规模、补贴标准、工作内容及要求、保障措施等。项目区各省级农业部门会同财政部门根据实施指导意见组织编制本省年度具体实施方案，并按规定时限报农业部、财政部备案。实施方案内容包括补贴政策目标、补贴重点、实施区域、补贴品种、管理措施等。项目区各省农业、农垦部门在编制实施方案时应当加强沟通，统一年度实施区域。
第七条 省级农业部门会同财政部门采取公开招标或通过公示竞选条件、基地申报、专家评审的方式，确认种苗基地，确定当年种苗基地的种苗销售价格，在媒体上公示种苗基地名单、公布种苗的销售价格和补贴后的销售价格等。种苗基地实行动态管理。
第八条 被确认的种苗基地应当挂牌公告补贴品种、类型、质量、确定的销售价格和补贴后的销售价格等信息，接受公众监督；按供苗标准、数量及补贴后的销售价格，及时为植胶人提供优良种苗；通过项目管理数据库报送相关数据，建立种苗生产和出圃档案，提供售后相关技术服务；与享受良种补贴的植胶人签订统一的购销合同，明确双方的权利和义务。
第九条 财政部根据确定的项目区各省补贴资金规模，按预算级次将中央财政补贴资金拨付到农业部或省级财政部门。农业部将补贴资金拨付到直属垦区，直属垦区将补贴资金的70%拨付到种苗基地，待项目实施结束，经验收合格后，拨付其余的30%；项目区省级财政部门按预算级次将补贴资金拨付到省级农垦或种苗基地所在的县级财政部门，省级农垦或县级财政部门将补贴资金的70%拨付到种苗基地，待项目实施结束，经验收合格后，拨付其余的30%补贴资金。
第十条 补贴项目实行审核制。农村植胶人提出良种补贴申请后，由村委会汇总并公示。公示的内容包括补贴面积、补贴标准、补贴对象、补贴金额等。公示时间不少于七天。公示期间，接受群众和社会监督，发现问题，及时纠正。公示无异议后，由村委会提出初审意见，乡镇政府审核后，报县（市）农业、财政部门审批。农场植胶人由农场组织公示审核后，报省级农垦部门审批。植胶人凭审批表，到被确认的种苗基地按扣除补贴后的价格购买种苗。在项目申报审核过程中应当及时填报项目管理数据库。
