（二）加工专用原料基地建设工程
在《优势农产品区域布局规划》确定的专用小麦、专用玉米、优质水稻、高油大豆、柑橘、苹果、甘蔗、肉牛肉羊、生猪、牛奶、水产品等13种优势农产品、41个优势产区内，按照农产品加工的具体要求，选育加工专用品种，并建立加工专用原料基地，以满足农产品加工业发展的要求。鼓励加工企业直接参与加工专用原料生产，按照国际通行标准建设加工专用原料基地，实现专业化生产、规模化种养、标准化管理，形成安全可靠的加工原料来源。建设的主要内容是：以优势农产品产业带及种、养基地为依托，以加工企业为龙头，建立一批与加工业配套的粮油、蔬菜、果品、畜禽、蛋、奶及水产品专用原料基地。到2010年，依据《优势农产品区域布局规划》，在全国培育50个具有区域特色、示范带动作用大的农产品加工专用原料基地，为农产品加工业健康发展提供原料保障。
（三）农产品加工技术创新工程
通过有效整合大专院校、科研单位和企业的力量，构建农产品加工业技术创新体系，形成农产品加工业技术创新机制。建设的主要内容是：加快农产品加工研发中心建设。加速农产品加工公共资源整合，以中国农业科学院为依托建设国家农产品加工研发中心，以中央或地方大专院校、科研单位为依托重点建设50个专业性的农产品加工研发分中心，解决农产品加工业重大技术创新、技术引进和技术推广问题。推进建立企业技术研发中心。在100家农产品加工骨干企业进行建立技术研发中心的试点，鼓励科研院所、大专院校与企业的产学研对接，组建专业性的农产品加工研发中心或农产品加工企业的技术创新机构，选准科研重点，进行联合攻关，获得一批具有自主知识产权的科技成果，促进建立以加工企业为主体，科研单位、大专院校为依托的自主创新机制。促进科技成果的产业化。用好农产品加工重大关键技术筛选的成果，每年对20～30项农产品加工适用和重大关键技术进行推广示范，通过研究、开发、引进、推广一批农产品加工重大关键技术、工艺和装备，突破农产品精深加工和综合利用方面技术瓶颈的制约，全面提升我国农产品加工业的技术水平，培育一批具有较高市场占有率的名牌产品。国家重点在农产品加工研发中心和骨干企业技术研发中心基础设施建设、农产品加工关键技术引进、开发上给予扶持。
（四）农产品加工质量安全保障工程
通过健全完善农产品加工质量标准和检测体系，加强从原料生产到加工全过程的标准化管理和质量控制，提高农产品加工质量安全水平。建设的主要内容是：制定并发布《“十一五”农产品加工标准制修订指南》。根据农产品加工业发展的特点以及国际国内标准的现状，研究、制定适合我国国情的农产品加工业标准制定（修订）框架指南，有效指导“十一五”期间我国农产品加工业标准的制定（修订）工作。构建农产品加工国际标准跟踪平台。及时收集、掌握和整理CAC、ISO等国际组织以及美国、日本、韩国、欧盟等主要贸易国农产品进出口标准及政策的发展动态，并随时反映国际农产品贸易中出现的新情况、新趋势和新问题，为广大农产品加工企业采取积极的应对措施和制定（修订）我国农产品加工标准以及政府科学决策提供参考依据。加强农产品加工全程质量控制体系建设。加快农产品加工企业推行良好生产操作（GMP）、危害分析与关键控制点（HACCP）和ISO9000族系质量管理与控制体系，进一步加强对已通过认证的企业后续监管。同时，完善农产品加工质量安全检测体系，充分发挥现有农产品质检机构的作用，拓展其检测范围，扶持鼓励现有省级质检中心开展农产品加工业质量安全检测工作；大力支持检测新技术的研究，逐步建立起一套完整的快速、便携、精确的检验检测技术体系，全面提高我国农产品加工业检验检测的能力。建立健全农产品加工企业质量安全诚信体系。研究食用农产品安全诚信的评价指标，建立食用农产品安全诚信监控网络，营造“重质量安全，守行业诚信”的氛围。
（五）农产品加工信息化建设工程
通过信息化带动，促进农产品加工业走新型工业化的路子。建设的主要内容是：健全完善农产品加工信息网络。通过对现有的农产品加工信息网的完善和改扩建，整合全国农产品加工信息资源，构筑县、市、省和国家多层次的农产品加工信息网络，为宏观决策、促进产业发展提供丰富的信息资源。推进农产品加工企业信息化。依托农产品加工信息网，建立农产品加工市场信息预警机制，为农产品加工企业经营管理提供重要依据；同时推动农产品加工企业开展电子商务应用，选择100家在电子商务应用方面有一定基础的农产品加工企业进行试点示范。探索建立农产品物流信息化平台。构建农产品加工、生产、运输、销售的物流信息数据库，对农产品物流各环节进行编码标识和信息采集，实现农产品物流的现代化、标准化和信息化，选择50家农产品加工企业开展物流信息化平台建设试点。
（六）农产品加工创业工程
