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在广州、深圳、东莞、北海、厦门等珠江三角洲，上海、张家港、宁波等长江三角洲和大连、青岛、烟台、日照等黄渤海等沿岸、沿海地区建设高级调合油、饲用蛋白、脂肪酸、甘油、维生素E、精制磷脂等生产基地和出口基地；在东北和山东、河南、河北、安徽等黄淮海地区发展大豆浓缩蛋白、组织蛋白、分离蛋白和大豆蛋白粉的生产，并丰富生产品种、开发其终端产品；加强非转基因原料基地建设，大力发展传统豆制品生产，带动区域经济发展。
3．稻米加工。开发具有良好市场前景的发芽糙米、留胚米、蒸谷米，高纯度米蛋白、米淀粉脂肪替代物、米糠多糖、米糠油、稻壳可降解环保餐盒等高附加值产品；开展米饭、米线、营养强化米、营养米粉等传统大米主食品的加工技术与装备的研究开发，发展米制食品工业化生产；建立健全稻谷加工标准体系、全程质量控制体系和快速检测体系。使日处理稻谷100吨以上碾米企业加工量占总加工量的比例提高到45％以上，标准一等以上大米占总量的90％，优质品牌化的大米供应量占全国城镇大米年消费总量的20％左右，工业化米制品产量占稻米总产量的20%。
在东北三省和江苏、江西、湖北、湖南等省培育年处理30万吨的加工龙头企业，并形成相应规模的碎米、米糠、稻壳综合开发利用能力；在四川、广西、云南、贵州、陕西、甘肃、宁夏等西部地区建设企业规模为年产3～5万吨的营养大米、营养米粉生产基地。
4．小麦加工。加强面包、饼干、蛋糕、馒头和面条等加工专用小麦品种的选育，建设优质原料生产基地；优先支持发展食品专用粉、营养强化面粉、预配粉，以及重点发展传统面制主食品工业化生产与应用，实现中式配餐、学生营养配餐及大众面制主食品的工业化生产；开展小麦加工副产品综合利用，开发麦胚食品等高附加值产品；培育和发展我国小麦加工业龙头企业，打造名牌产品，提高产业规模效益和集约化程度；实现面制食品手工制法向工业化生产的转变，使小麦专用粉加工量达到面粉总加工量的18％、日处理小麦200吨以上的面粉企业加工量占总加工量的比例达到50％、小麦副产品及综合利用率提高到10％。
在河北、山西、江苏、安徽、山东、河南、陕西、甘肃、新疆发展以优质强筋小麦为原料，生产面包、面条、馒头等专用小麦粉为主的加工企业；在江苏、安徽、河南的部分地区和湖北发展以优质弱筋小麦为原料，生产饼干、蛋糕专用小麦粉为主的加工企业；在黑龙江、内蒙古发展以强筋春小麦为主要原料，生产面条、馒头等专用小麦粉为主的加工企业；在小麦主产区培育日处理小麦1000吨以上的大型面粉加工企业，并提高综合利用水平，京津沪、广东发展日处理面粉10万吨以上的传统面制品和日产20万包以上的方便面工业化生产。
5．油菜籽加工。发展高产“双低”、专用高芥酸、高油酸、高硬脂酸等品种，建立加工专用原料基地；开发和推广菜籽干法脱皮、低温冷榨、膨化浸出、低温脱溶、物理精炼等制油新技术、新设备，减少环境污染，提高产品质量，降低能耗；利用菜籽饼粕、皮壳、油脚等副产物，开展综合利用技术研究，开发生物柴油、润滑油、油墨涂料等新产品，使菜籽精炼油年产量增加到600万吨，油菜籽加工设备国产化能力由70％提高到90％，脱皮、低温压榨、膨化浸出等制油新技术得到推广应用。
在重庆、四川、云南、贵州、青海等长江上游地区、安徽、江西、湖北、湖南及河南信阳等长江中游地区，上海、江苏、浙江等长江下游地区进行加工企业布局。企业布局生产规模要大、中、小相结合，优势产区应重点发展大型加工企业；产品档次要高、中、低相结合，以发展高中档产品为主，油菜籽优势产区应重点发展高档产品。
6．薯类加工。开展高淀粉型、油炸型、高蛋白型等马铃薯加工专用品种的选育和贮运技术研究，提高加工原料的品质；开展薯类淀粉和变性淀粉技术研究，提高薯类淀粉和变性淀粉加工水平；开展马铃薯条（片、全粉）、甘薯方便湿粉等技术研究与开发，增加薯类食品的品种，提高产品的质量；加强废弃物的综合利用，发展配合饲料生产，解决薯类加工厂废弃物污染问题。使薯类加工转化率提高到25％，深加工转化率提高到10％。薯类淀粉总产量增加到150万吨，变性淀粉增加到30万吨，薯类食品增加到50万吨，薯类加工设备国产化能力由70％提高到90％。
马铃薯与甘薯类加工企业主要在河北、山西、内蒙古、辽宁、吉林、黑龙江、福建、山东、湖北、湖南、重庆、四川、云南、贵州、陕西、甘肃、宁夏等地布局；木薯加工企业主要在广西和广东布局。加工企业生产规模要大、中、小相结合，薯类优势产区应重点发展大型企业，产品档次要高、中、低相结合，以发展高中档产品为主，薯类优势产区要重点发展高档产品为主。
7．特色杂粮加工。加强燕麦、荞麦、啤酒大麦、小米，以及红小豆、绿豆、蚕豆等食用豆类等特色杂粮加工特性研究，建立优质加工专用原料基地；利用新工艺、新技术和新装备，开发和生产适销对路、竞争力强、技术含量高的产品，扩大产品的应用领域；优先发展功能性、营养型早餐类食品，加强传统食品的改造和工业化生产，开展燕麦β－葡聚糖、荞麦黄酮等高附加值成分的研究，开发具有保健功能的特色食品；开发燕麦早餐食品、荞麦传统食品、大麦茶、小米饮料、豆类食品馅料等产品，并拓宽产品的应用范围，满足多样化的市场需求。
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