四、各级交通管理部门设置的港航监督机构是对内河交通安全实施统一监督管理的主管机关。从事营运的乡镇船舶的所有人或者经营人，应到所在地港航监督机关及有关部门申请办理《船舶检验证书》、《航行签证簿》、《营业执照》等证件（出海的乡镇船舶还须持有《船舶户口簿》或者《出海船民证》）；按国家规定交纳税、费和港航规费以及办理船舶保险（包括船舶碰撞责任险）；并按港航监督部门的规定，标定“船名牌”、勘划“载重线，配齐合格的持证船员。否则，不得从事客货运输。
乡镇船舶所在地的公安机关要加强船舶户口和治安管理，建立健全水上治安保卫组织，严厉打击利用乡镇船舶流窜作案的犯罪分子。对利用乡镇船舶进行聚财、盗窃、偷渡、走私、倒卖国家禁止自由买卖的物资等违法犯罪活动者，由公安等部门根据国家有关规定严肃查处。
在江河、近海和名胜湖泊、水库载客游览的乡镇船舶，除应具备良好的适航性能外，还要做到船貌美观、船容整洁卫生。
所有乡镇船舶应根据技术条件按规定的航线和航区航行，严禁违章超载、冒险航行，禁止任何单位和个人租用无证、无照船舶进行运输。港航监督机关要加强现场监督检查，制止违章航行，对严重违章者要严肃处理。今后，凡乡镇船舶发生重大责任事故，除依法追究肇事人责任外，还要追究直接行政领导和有关主管部门的领导责任。
五、各省（区、市）要对航道、港口、码头现有的船舶检查站（点）进行整顿和调整。由交通主管部门会同公安、工商行政管理、税务、乡镇企业等有关部门，根据需要，提出设立联合检查站（点）的方案，经省（区、市）人民政府批准后实施。除此以外，任何单位和部门都不得在航道、港口和码头上拦截船舶进行检查、收费、罚款。在未设联合检查站（点）的地方，有关部门如需单独设点进行检查，要经省（区、市）人民政府批准。
有关单位和部门在检查时，要出示省一级单位统一颁发的执勤证件。
六、凡拥有一定数量船舶的区、乡（镇），要设置“乡镇船舶监督管理员”，在区、乡（镇）人民政府领导下，对乡镇船舶实行监督管理，业务上受所在地区县以上港航监督机关的领导。
乡镇船舶监督管理员的工资福利、办公费用在乡镇船舶管理费中支付。乡镇船舶管理费，由乡镇船舶监督管理员按船舶吨位或马力向从事营运的乡镇船舶征收，上交所在地县以上港航监督机关统一掌握，专款专用。收费标准由各省、自治区、直辖市交通厅（局）制定，经省、自治区、直辖市人民政府批准执行。完全义渡及农民专门用于农业生产的船舶免征乡镇船舶管理费。
七、港航监督机关在办理乡镇船舶登记和进行现场监督检查时，可同时查验《营业执照》、《税务登记证》和保险单据等有关证件。对未办理上述证件的乡镇船舶，应督促其按规定补办。发现偷漏税等行为时，要协助税务等部门依法处理。
