项目根据我国地理气候特征、生态类型、城乡统筹区域特点及产业结构类型的特点，共设置3个技术集成与区域示范课题和1个共性技术集成与综合示范研究课题。具体课题是：
1、城乡统筹农村生活污水污染控制技术与示范
2、城乡统筹农村生活垃圾污染控制技术与示范
3、生态保护城乡统筹关键技术与示范
4、城乡统筹生活污染控制和生态建设共性技术与综合示范
三、实施期限
本项目实施年限为3年，从2009年1月～2011年12月。
四、经费来源
项目经费预算总经费3750万元，其中国拨经费1500万元，地方配套经费2250万元，配套经费由示范项目所在地政府按1∶1.5的比例进行配套，同时，积极吸引社会投入，扩大项目经费来源渠道，地方配套经费主要应用于示范推广。
五、申请管理
1、环境保护部作为项目组织单位，负责项目的组织实施。
2、根据《
国家科技支撑计划管理暂行办法》的规定，遵循“公开申报、专家评审、择优选择”的原则，选择承担单位。
3、申请内容应在指南所设课题范围之内，课题申报必须以某一课题整体研究内容为申请单元，只针对课题部分内容的申请为无效申请。
六、申请资格
（一）申报单位的条件和要求
1、凡在中华人民共和国境内注册，具有较强科研能力和条件、运行管理规范、具有独立法人资格的高等院校、科研院所、内资或内资控股企业等单位，均可申报，不接受个人申请。
2、课题申报必须以某一课题整体研究内容为申请单元，积极鼓励科研单位和企业以产学研结合的方式联合申报。每个课题的联合申请方原则上不超过6个法人单位，形成多学科协作团队，联合申请各方须签订联合申请合作协议，明确规定各自承担的任务和责任。课题申请材料经由牵头单位所属部门科技司或所在省（自治区、直辖市）科技厅（委）、新疆生产建设兵团科技局审定盖章后，进行申报。
3、区域示范类课题第一承担单位应是长期从事城市和农村污水处理、固体废物处理、生态建设、生态规划等技术及环保管理机制和相关环境保护研究，熟悉城乡环保工作和农村情况，并具有高水平的科研队伍、较好研究基础和试验示范条件的科研院所、高等院校等企事业单位，并联合地方政府共同提出课题申请。每个省份只能申报1项所属区域内的示范课题。
4、共性技术研究类课题申请单位原则上以科研院所、大专院校为主体，并联合相关企业共同申请，鼓励企业参与。承担单位需具有前期研究基础和示范基地等必要的实施条件。
5、申报课题的企业应具备承担相应国家级科研课题的综合能力，资产负债率低于2/3，无行政处罚或违法记录。
6、申报单位经费须专款专用，设立单独账簿，独立核算，并保证配套资金及时到位，保障课题研究工作的顺利实施。
7、成果查新证明须由有资质的国家或部省级查新单位出具。
（二）申请负责人的条件和要求
1、课题负责人须具有高级以上职称，有固定单位（不包括在站博士后），年龄不超过60周岁（截止到2009年5月31日），具有较高的学术水平、无不良科研行为。课题负责人用于本课题研究时间不少于本人工作时间的60%，在国内工作时间不少于9个月。
2、所有课题申请人均不得参与两项以上本项目课题的申报，且只能主持申报一项本项目课题。课题申报单位（包括联合申报中的任意一方）和主要申报人，对同一个课题不得进行重复或交叉申报。在研的国家科技主体计划（863计划、973计划、支撑计划）的课题主持人不能牵头申报本项目的有关课题。
经形式审查，申请单位或申请负责人不符合上述规定的申请书视为无效申请，不参与专家评审。
七、申请文件的编制与递交
1、文件编写：以中文编写，要求语言精炼，数据真实、可靠。
2、文件规格：一律用A4纸，仿宋体四号字打印并装订成册，一式15份，同时附上电子版。申请书按统一格式编写。
3、申请文件构成：
（1）申请函
（2）申请人资格审查文件
（3）课题申报书
（4）附件（申请单位承诺函、联合申请合作协议、申请单位营业执照或法人代码证复印件、申请单位资格申明函、申请单位资信证明、配套经费承诺函、近两年度资产负债表、损益表及现金流量表等）
4、课题申报书及有关资料应有法定代表人（或委托授权人）签字并加盖公章，全部申请文件须包装完好，封皮上写明申请课题、申请单位名称、地址、邮政编码、电话、联系人，并加盖第一申请单位公章。
5、申报工作自本指南公布之日起开始，申报单位必须根据《课题申请指南》要求参与申报活动。《课题申请指南》可从科技部网站（www.most.gov.cn）或国家环保部（www.mep.gov.cn）网站上下载。
6、寄送申请文件的截止日期：2009年6月8日下午16：00时整。只接收在申请截止日期前报送申请文件，邮寄材料以北京邮局签收日为准。申请文件在邮寄过程中出现的遗失或损坏责任自负。
7、寄送地点：环境保护部科技标准司（北京市西直门内南小街115号，邮编：100035）
联系人：张 明 王泽林
电话：010-66556211 传真：010-66556206
E-mail：zhangming_mep@126.com wang.zelin@mep.gov.cn；
八、课题评审
经形式审查，不符合上述规定的申请书视为无效申请，不参与专家评审。遵循“公开、公正、公平”的原则，我们将组织专家对申请课题进行评审，择优确定课题承担单位。
九、课题管理
