43．海陵湾近江牡蛎国家级水产种质资源保护区
海陵湾近江牡蛎国家级水产种质资源保护区总面积1000公顷，其中核心区面积为300公顷，实验区面积为700公顷。核心区特别保护期为4-5月和9-10月。保护区位于广东省阳江市海陵湾北部海域，范围在东经111°43′4.8″-111°47′16.8″，北纬21°44′46.7″-21°45′52.6″之间。核心区是由8个拐点顺次连线围成的海域，拐点坐标分别为（111°43′4.8″E，21°45′27.7″N； 111°43′48″E，21°45′45″N；111°44′13.2″E，21°45′40.3″N； 111°44′38.4″E，21°45′51.1″N；111°44′49.2″E，21°46′1.2″N； 111°45′7.2″E，21°46′1.2″N；111°45′7.2″E，21°45′35.6″N； 111°45′3.6″E，21°45′9.4″N）。实验区是由14个拐点顺次连线围成的海域，拐点坐标分别为（111°43′4.8″E，21°45′27.7″N； 111°43′48″E，21°45′45″N；111°44′13.2″E，21°45′40.3″N； 111°44′38.4″E，21°45′51.1″N；111°44′49.2″E，21°46′1.2″N； 111°45′7.2″E，21°46′1.2″N；111°45′7.2″E， 21°45′35.6″N； 111°45′14.4″E，21°45′11.5″N；111°45′50.4″E，21°44′57.5″N； 111°45′50.4″E，21°45′19.4″N；111°46′48″E，21°45′52.6″N； 111°47′9.6″E，21°45′46.1″N；111°47′16.8″E，21°44′46.7″N； 111°44′31.2″E，21°44′46.7″N；111°45′3.6″E，21°45′9.4″N）。主要保护对象为近江牡蛎，其它保护物种包括翡翠贻贝、栉江珧、文蛤、波纹巴非蛤、蝾螺、裸体方格星虫、泥蚶等。
44．西江赤眼鳟海南红鲌国家级水产种质资源保护区
西江赤眼鳟海南红鲌国家级水产种质资源保护区总面积2300公顷，其中核心区面积为920公顷，实验区面积为1380公顷。核心区特别保护期为4月1日-7月1日。保护区位于广东省云浮市南江口河段，范围在东经111°48′42″-111°54′13″，北纬23°08′17″-23°06′01″之间。核心区位于南江口镇到讴塘江段，范围在东经111°48′42″-111°49′27″，北纬23°07′43″-23°08′17″。实验区分三部分，第一部分位于南江口镇-南瑶，范围在东经111°48′42″-111°49′27″，北纬23°7′43″-23°8′50″；第二部分位于讴塘-下咀，范围在东经111°51′55″-111°54′13″，北纬23°6′1″-23°7′43″之间；第三部分位于南江河河段从河口往上游约4公里，范围在东经111°49'15"-111°49'14"，北纬23°07'43"-23°06'01"之间。主要保护对象是赤眼鳟、海南红鲌和黄尾鲴，其他保护物种包括鳗鲡、花鲈、鮻、鳡、鳤、青鱼、草鱼、鳙、鲢、鲮、鲫、团头鲂、广东鲂、鳊、蒙古鲌、红鳍原鲌、银鲴、斑鳠、黄颡鱼、黄鳝、大眼鳜、斑鳢、日本沼虾等。
45. 漓江光倒刺鲃金线鲃国家级水产种质资源保护区
漓江光倒刺鲃金线鲃国家级水产种质资源保护区总面积为255.5公顷，其中核心区面积为50.0公顷，实验区面积为205.5公顷。核心区特别保护期为全年。保护区位于广西自治区桂林市的漓江，由漓江干流冠岩河段及支流桃花江河段两部分组成。核心区位于漓江干流的冠岩潭至浪洲潭河段，范围为（25°03′06.5″N，110°27′04.1″E）至（25°02′06.4″N， 110°26′58.5″E）。实验区分为三个区域：其一，自漓江黄牛甲12号航标灯塔至冠岩潭，范围为（25°06′34.7″N， 110°25′04.9″E）至（25°03′06.5″N，110°27′04.1″E）；其二，自漓江浪洲村码头至鸳鸯滩桃源村码头，范围为（25°02′06.4″N，110°26′58.5″E）至（25°01′31.5″N， 110°27′31.7″E）；其三，自桃花江上游北冲村至鲁家村滚水坝，范围为（25°18′35.0″N，110°16′33.2″E）至（25°17′52.6″N， 110°16′09.4″E）。主要保护对象为光倒刺鲃、金线鲃以及冠岩潭、浪洲潭2个鱼类越冬场，黄牛甲、社公滩、斗米滩、鸳鸯滩4个鱼类产卵场，其他保护物种包括漓江鳜、黄喉拟水龟、花鳗鲡、多瘤丽蚌、大鲵、长麦穗鱼等。
46. 西沙东岛海域国家级水产种质资源保护区
西沙东岛海域国家级水产种质资源保护区总面积30870公顷，其中核心区面积为11113公顷， 实验区面积19757公顷，核心区特别保护期为全年。保护区位于海南省西沙群岛海域中东岛周围的礁盘区，核心区位于东岛以外，是由4个拐点顺序连线围成的海域，拐点坐标分别为（112°42′E，16°42′N；112°45′E，16°42′N；112°42′E，16°39′N；112°45′E，16°39′N）。实验区是由核心区向外围延伸，4个拐点顺序连线围成的海域，拐点坐标分别为I（112°41′E ，16°43′N；112°46′E，16°43′N；112°41′E ，16°38′N；112°46′E，16°38′N）。主要保护对象是石斑鱼类、鲨鱼类、龙虾类、海参类、海胆类、马蹄螺、篱凤螺、砗磲、冠螺、红珊瑚、鹦鹉螺等热带海珍品种。
47. 长江重庆段四大家鱼国家级水产种质资源保护区
长江重庆段四大家鱼国家级水产种质资源保护区总面积12310公顷，其中核心区面积3375公顷公顷，实验区面积8935公顷。核心区特别保护期为2月1日-6月30日。保护区位于重庆市境内南岸区广阳镇至涪陵区南沱镇的长江江段，范围在东经106°43′45″-107°31′53″，北纬29°35′05″-29°51′34″之间。其北岸是：广阳镇一人码头（106°43′31″E，29°35′21″N）-鱼嘴-洛碛-朱家-凤城-镇安-李渡-黄旗-百胜-珍溪-南沱（107°32′01″E，29°51′40″N）。其南岸是广阳镇-木洞-双河口-江南-石沱-蔺市-龙桥-涪陵-清溪-南沱。核心区由3段河段组成，巴南区木洞镇（106°56′05″E，29°34′46″N）-渝北区洛碛镇（106°56′05″E，29°42′10″N）；涪陵区镇安镇（107°08′49″E，29°42′17″N）-蔺市镇（107°12′17″E ，29°40′40″N）；涪陵区珍溪镇（107°27′30″E，29°53′04″N）-南沱镇（107°32′03″E，29°51′41″N）。实验区由3段河段构成，南岸区广阳镇（106°43′45″E，29°35′05″N）-巴南区木洞镇（106°56′05″E，29°34′46″N）；渝北区洛碛镇（106°56′05″E，29°42′10″N）-涪陵区镇安镇（107°08′49″E，29°42′17″N）；涪陵区蔺市镇（107°12′17″E，29°40′40″N）-珍溪镇（107°27′30″E，29°53′04″N）。主要保护对象为四大家鱼，其它保护物种包括达氏鲟、白鲟、胭脂鱼、铜鱼、圆口铜鱼、中华倒刺鲃、岩原鲤、南方鲇、长吻鮠、大鳍鳠、长鳍吻鮈、翘嘴鲌、大鲵、水獭等。
48. 大通江河岩原鲤国家级水产种质资源保护区
大通江河岩原鲤国家级水产种质资源保护区总面积为979.5公顷，其中核心区面积为700公顷，实验区面积为279.5公顷。核心区特别保护期为全年。保护区位于四川省通江县大通江河兴隆乡浴溪村二社九浴溪大桥至永安镇碧溪七村一社碧溪水文站、支流月滩河瓦室镇长胜大桥至瓦室镇长胜四村一社石洞口之间。范围在东经107°14′-107°20′，北纬32°05′-32°12′之间。保护区河流全长28公里，其中碧溪水文站-瓦室镇一村-社清滩为实验区，长8公里；其余河段为核心区，长20公里。其东岸是浴溪乡浴池岭村，瓦室镇雨花村、桂花村、钟林村、笔架村，烟溪乡烟溪沟村、向家营村，永安镇碧溪村；西岸是瓦室镇南跃村、岗岭村、九龙村，烟溪乡罗张窝村。主要保护对象为岩原鲤、中华鳖、华鲮等。
49. 郪江黄颡鱼国家级水产种质资源保护区
郪江黄颡鱼国家级水产种质资源保护区总面积520公顷，其中核心区面积400公顷，实验区面积120公顷。核心区特别保护期为全年。保护区位于四川省遂宁市大英县的郪江江段，四川盆地东中部腹心地带，范围在东经105°10′01"-105°26′41"，北纬30°37′36"-32°42′30"之间，全长65公里，从起点到终点依次经过：象山镇-蓬莱镇-隆盛镇-回马镇。核心区位于郪江象山镇凤阳村-蓬莱镇火井村和隆盛镇黄腊溪村-郪江末端（回马镇双江社区），范围在东经105°10′01"-105°12′31"，北纬30°27′16"-32°42′30"之间和东经105°18′01"-105°26′41"，北纬30°37′36"-32°12′10"之间，长50公里。实验区位于蓬莱镇火井村-隆盛镇黄腊溪村，范围在东经105°12′31"-105°18′01"，北纬30°27′16"-32°12′10"之间，长15公里。主要保护对象为黄颡鱼、鳜鱼、中华鳖，其他保护物种包括大口鲶、乌鳢、鲫等。
50. 渠江黄颡鱼白甲鱼国家级水产种质资源保护区
渠江黄颡鱼白甲鱼国家级水产种质资源保护区总面积1299.3公顷，其中核心区面积383.8公顷，实验区面积915.5公顷。核心区特别保护期为全年。保护区全长65公里，位于四川省广安市广安区境内，范围在东经106°32′-107°03′和北纬30°18′-30°50′之间。核心区位于肖溪镇南溪村-白马乡洪江村，长19.2公里。实验区位于肖溪镇勤劳村-肖溪镇南溪村（实验区第一段）和白马乡洪江村-大龙乡光华村（实验区第二段），全长45.8公里。主要保护对象为黄颡鱼、白甲鱼，其他保护物种包括长薄鳅、大鳍鱯、长春鳊、岩原鲤、中华倒刺鲃、南方大口鲶、鳜、细鳞斜颌鲴、华鲮、翘嘴红鲌、乌鳢、鲤、鲫等。
