2006年12月，日本海洋政策研究财团和海洋政策委员会联合发表了《日本海洋政策大纲——寻求新的海洋立国》和《海洋基本法概要》。在海洋管理方面，提出应在内阁增设拥有职权并能强力推进海洋综合政策——“综合海洋政策会议”等的海洋组织机构，来调查、审议海洋相关政策及规划、调整海洋政策资源的分配方针、评价重要研究开发活动及其政策等；任命海洋政策大臣，以有效地统管专业性和连续性强的海洋政策，展开综合管理活动，推进海洋的综合性管理。
2007年4月20日，日本国会通过了《海洋基本法》，确立了旨在促进海洋资源开发利用、确保海上交通安全的海洋基本政策。该法强调要采取必要措施保护“孤岛”，认为“孤岛”对保护日本领海与专属经济区、确保海上交通安全、促进海洋资源开发利用以及保护海洋环境等具有重要战略意义。
2007年7月20日，日本政府宣布正式实施《海洋基本法》，并同时成立“海洋政策本部”。这标志着日本已经基本完成有关加强海洋资源开发向海洋强国迈进的立法、机构设置和人员配置等基础工作。[2]
为了保障本国的能源运输安全，日本对关系国家经济命脉的战略物资——石油的进口，更重视发挥国轮的优势，规定由国轮承担全部运输任务，或者优先使用国轮运输，以确保国家战略物资储备和能源的安全。对航运企业实行非常有利于本国船队营运的保护政策，在买、造船方面给予补贴和低息贷款，对本国商社租用本国船队也给予一定程度的税费减免。日本原油年进口量2.5亿吨以上，日本船东控制的大型油轮吨位超过了700万吨，可以满足日本80%以上石油进口的运输需求。
此外，在加强内港海运安全与管理措施上，2003年9月，日本响应美国“防止大规模杀伤性武器扩散构想”，批准了一系列对走私大规模杀伤性武器部件的飞机和船只进行拦截的方案。2004年1月，日本各主要港口设置港湾危机管理官，并均由海保厅相关管区的负责人担任，加大了海上和港口反恐怖力量的指挥和协调。2005年，海上保安厅与水产厅利用卫星技术建成了新的海上监控系统与海上图像分析系统，该系统可以全面监视“识别区域”内的船舶，并可根据数据资料对目标图像进行分析，提供及时、准确的情报信息。
二、日本海上安全与反恐保障具体法律制度
（一）海上安全法律的具体规定。2001年10月29日，日本通过了《反恐怖特别措施法案》（简称《反恐怖法案》）、《自卫队法修正案》和《海上保安厅法修正案》。随后2003年4月通过了“有事三法案”：《武力攻击事态因应法案》、再次修订的《自卫队法修正案》以及《安全保障会议设置法修正案》。
