行为不确定，系指难以监控契约双方当事人在订立契约後的行为。在市场上，从订立契约起到契约确实履行通常要持续一段时间，而在这段期间内，可能会发生很多影响交易双方当事人权利、义务的因素，而影响到契约的履行。又因为缔约双方当事人可能出现机会主义行为，一旦市场条件变化对其不利时，则可能在不违反法律的前提下，造成另一方交易当事人的损失，为了避免此种情况发生，交易双方当事人尽可能希望将契约写的详尽，约定未来一切可能的状况，以及状况发生时双方当事人的权利、义务关系。
但是在现实社会中，由於环境充满不可预期性和各种变化，任何契约都不可能是完全的，也因此留给机会主义者可乘之机。若交易本身越为复杂，交易双方均将未来的不确定性及复杂性纳入契约，使得交易过程增加不少订立契约时的议价成本，则交易成本自然也将越高，则单纯以市场作为一种管理机制，可能无法符合双方当事人的要求，甚至可能无法完成交易。
四、以治理为组织核心
以上我们可以得知，威廉姆森认为专用性资产、交易频率、不确定性等因素
都将影响交易成本的高低，并且将产生交易的风险（包括协调问题、环境适应的问题、确保契约履行的问题、评估交易双方行为的风险）。因此威廉姆森开始思考如何能降低交易成本，而使双方效益达到最大化，威廉姆森认为应该以契约作为基础，厂商不再只是传统上生产函数的架构，而应把厂商作为治理的架构。威廉姆森认为以厂商代替原先市场上的议价体系，可拥有三种优势：激励、控制、内部结构。
1.激励
虽然市场上自由竞争可以达到产品最适价格与数量，而达到激励的效果，但是在公开讨价还价的过程中，也将给予机会主义者见缝插针的机会，因此使交易成本增加。但是，在内部组织中，不同部门的关系是长期的，所核算的内部转让价格亦有一定的内部规则可依循，当不同部门间（如研发部门、市场部门）发生争执时，也能由上级机关统一协调纷争，减少双方议价的成本。虽然企业内部组织成员较缺乏激励的因素，无法确保各部门间能够为共同目标努力，但是仍可透过内部激励制度的运作，而达到一定程度的激励效果。
换句话说，在市场运作一切激励措施都以最适的价格为基础，以达到双方利润极大化，但组织内部的激励措施可能具有多样性，有的激励措施可以奖金作为手段，有些却不具体以金钱作为媒介，这使得组织内部完成与市场同样的激励效果，且仅需较少的交易成本。若交易越复杂，企业愈有可能综合地采取多样的激励手段，而透过组织内部所需的成本也将更为降低。
2.控制
威廉姆森认为组织相对於市场竞争，最具特色的优点在於控制手段更为多样及具有弹性，此种控制手段不仅对促进单一企业内部资源配置具有效率，而且对於集团内各企业的资源配置亦具有效率。组织内部，不仅拥有可合法进行管制的权限，也可以较低的成本取得讯息，进而可评估所得讯息以做出决策。同时组织内部的控制手段也具多样化，例如组织内部可以选择雇用或解聘、升职或降职、加薪或减薪等手段进行内部控制，而此种灵活性是市场无法比拟的。进一步来说，当发生纠纷时，内部组织具有能更有效解决纠纷的机制，而无须诉诸法院，大幅降低了控制成本。
3.内部结构优势
组织的存在逐步实现了功能化、内部化，在运行过程中有利於提高组织内资讯传输的效率，并降低了讯息成本。在内部组织内，透过人与人之间相互作用的积累，可进一步发展出通讯的经济，在熟悉的环境上，微小的变化即能产生明显的影响；而在不熟悉的关系中，则需要付出很大的努力才能获得相同的效果。因此企业可能出於节约讯息成本，而进行交易的内部化，即所谓的企业合并。
五、不同商业组织的比较评估
如上所论，「交易」是制度经济学的最小单位，系指具有可分离性的物品在人们之间的让渡，它反映的是人与人之间的关系，威廉姆森认为交易中的不确定性决定了交易属性的差异性，交易属性的差异性又是多样性契约存在的基础。由於不确定性、有限理性、机会主义以及资产专属性、交易频率等因素的存在，一项交易可能会出现差异性，而要完成这项交易就应对交易属性进行充分的认识。
而透过以上三种有利因素的综合作用，使得企业组织内部的资源方是有利於市场机制，也使我们进一步思考是否该以内部组织的运作取代市场机能？或者该在何种情况下以内部组织取代市场机制？以下将介绍威廉姆森所提到的组织结构，可分为以下四种：市场治理架构（market governance）、三方治理架构（trilateral governance）、双边治理架构（bilateral governance），以及内部化治理架构（internalized governance）。
威廉姆森将交易关系依照交易频率（frequency）以及交易属性（investment characteristics）分为六类，而分别对应不同的治理结构[29]，其中三方治理架构与双边治理架构，可合称为混合型组织（hybrid），系一种介於市场与组织之间的体制，既具市场的特点，亦有组织的特点：其成员拥有独立的利益，并且可以进入和退出，由此，如同市场关系；但是，成员之间的交易藉助某种保障机制而具有一定的长期性质，由此，成员一般并不能轻易的进入和退出，并且形成了共同利益最大化的行为倾向，这又相似於企业内部组织之间的关系[30]。
圖表 3
|
交易屬性 |
非專屬性 |
混合型 |
專屬性 |
交
易
頻
率 |
偶然性 |
市場治理架構 |
三方治理架構 |
經常性 |
雙邊治理架構 |
內部化治理架構 |
1.市场治理架构
市场治理架构主要是用在非资产专属性条件下，以及偶然性或经常性的交易，称为古典式契约（classical contract）[32]。交易双方於充分资讯下，依据经验、资讯评估，以及与对方交易可行性，并不考量交易的维持性。交易双方个人特性於此并无关联，所签定之契约条款详尽规范双方当事人的权利义务关系，而当一方当事人不履行契约时，由法院介入处罚违约的当事人，此类契约可防止机会主义的行为。
2.三方治理架构
