随着改革的深入和社会经济的不断发展，为了适应新的要求，方便司法，增强可操作性。1993年10月22日最高人民检察院办法《关于认真查办巨额财产来源不明罪案件的通知》，将巨额财产来源不明罪中“数额巨大”的立案标准确定为5万元，这一规定贯彻了罪刑法定原则的基本要求，适应当时司法的迫切需要。

　　1997年10月1日，经过全面修订的新刑法对巨额财产来源不明罪进行了修改，将其纳入新刑法的贪污贿赂罪一章中，规定“国家工作人员的财产或者支出明显超过合法收入，差额巨大的，可以责令其说明来源。本人不能说明其来源是合法的，差额部分以非法所得论处，处五年以下有期徒刑或者拘役，财产的差额部分予以收缴。”

　　至此，伴随我国刑法典的进一步完善，巨额财产来源不明罪这一罪名也“花落有家”，新修改的条文从立法技术、刑罚设置、刑罚适用等都具有极大的进步。在该罪归入刑法典后不久，为了进一步结合打击犯罪的形势，最高人民检察院将其立案标准相应的提高到10万元。1998年8月，最高人民检察院在《关于人民检察院直接受理立案侦查案件立案标准的规定（试行）》中，又将立案标准再次提高为30万元。

　　进入21世纪以来，我国贪污受贿案件有增无减，而且在数量、人员、数额等方面急速攀升。而1997年刑法典的规定由于规定的最高刑为五年有期徒刑，而且还存在其他的缺陷，为了有效的遏制贪污腐败现象，建设廉政政府。2008年8月25年，千呼万唤始出来的《刑法修正案七（草案）》，建议将最高有期徒刑增至10年。其全文是：“国家工作人员的财产和支出明显超过合法收入，差额巨大，可以责令其说明来源，本人不能说明其来源合法的，差额部分一非法说的论处，处五年以下有期徒刑或者拘役；差额巨大的，处五年以上十年以下有期徒刑。财产的差额部分予以追缴”。该草案的出台，引起了社会的广泛关注，也是预防和打击贪污贿赂犯罪的一大利剑。2009年2月28日年中华人民共和国刑法修正案（七）第十四规定，将刑法第三百九十五条第一款修改为：“国家工作人员的财产、支出明显超过合法收入，差额巨大的，可以责令该国家工作人员说明来源，不能说明来源的，差额部分以非法所得论，处五年以下有期徒刑或者拘役；差额特别巨大的，处五年以上十年以下有期徒刑。财产的差额部分予以追缴。”