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非税收入银行代收是贯彻实施“收支两条线”的重要形式和手段。非税收入实行银行代收管理办法的核心，就是执收单位在向缴款人收费时，与现金实行彻底分离。具体操作办法是取消执收单位的收入过渡户，执收单位只能向缴款人开票，由缴费人持票到财政指定的银行代收网点缴费，资金通过银行代收网点直接缴入同级财政非税收入归集专户。
发展和完善银行代收，有助于实现非税收入征管规范化、信息化的目标；有助于从制度和管理上扭转随意占压、挪用财政性资金的现象；有利于构建财政部门、执收单位规范、高效的收费票据领购、核销管理体系；有利于遏制自立收费项目、自定收费标准等乱收费行为。；有利于实现主管部门和单位财务监管的管理目标。
4．严格非税收入票据管理
票据的管理是非税收入征收管理的源头，也是监督执收单位是否认真执行“收支两条线”规定的一个关键环节。加强票据管理总的原则，是要做到统一领发，统一使用，统一保管，统一核销和统一监督，力求票据与项目相结合、票据与收入相结合、票据与稽核相结合。
今后加强票据管理，首先，要统一规范并扩大票据覆盖面，强化稽查工作，充分发挥票据的源头控管作用，做到“以票管费、以票促收”，监督单位收取的费款是否及时足额上缴财政专户，并制止各种乱收费行为。其次，要改变财政票据种类繁多、混乱和管理不统一的状况，减少或归并，探索设计出更加精简有效和管理严密的收入票据。目前在不少地方改革中出现的统一的“非税收入一般缴款书”是一种很好的模式，值得借鉴。从实际运行来看，这一模式一方面有利于减轻执收单位的收费成本和提高执收单位开票、记账、对帐的工作效率；另一方面可以通过代码标准化的管理，使票据号码进入计算机网络管理，银行代收发生的每一笔收（缴）费业务，财政计算机网络都将自动核销一个凭证号码，使收费票据自始至终处于有效的监控之下。
5．建立和完善非税收入征缴管理信息系统
从某种意义上说，财政非税收入收缴管理信息系统的建设水平，决定着非税收入能否真正实现收支两条线管理。目前，中央与地方的分成收入和地方代收中央收入，都是通过主管部门收取后再层层上缴，存在问题较多。一是由于缺乏有效的监督机制，代收部门存在缴库不及时、截留、占压和挪用中央收入的问题；二是按照很多地方的收缴分离办法，这部分收入首先要缴入同级财政专户，然后通过返还的方式返还主管部门，再由主管部门层层上缴，不仅缴库时间长，有些地方财政部门还要征收一定比例的政府调节基金；三是中央和地方重复计收入。解决这一问题的根本办法，是中央和地方共用一套非税收入收缴管理系统。但由于中央各部门以及中央和地方之间情况千差万别，系统建设难度较大，并且随着改革深化的需要，又对系统提出了更高的要求。
目前，非税收入收缴管理信息系统亟需在财政综合管理、公共信息查询、执收单位软件、全国非税收入收缴管理信息系统建设等方面进一步完善。现代计算机数据交换、网络技术和银行资金清算体系，为实现非税收入征缴、审核、统一监管的一体化提供了有利的技术条件支撑。要结合“金财”工程的整体部署，特别是以 “金财”工程中的收入管理系统为依托，通过银行代收和相关应用软件的不断完善，实现非税收入管理信息化、科学化、智能化、网络化的管理目标，控制执收单位的收入项目、标准、账户设置、票据使用等，规范执收行为，有效防止乱收费等问题的发生，并通过信息系统，对政府非税收入的来源、结构、规模等动态变化情况进行监管和分析，提高财政监管能力。
6．强化对基金专户、预算外资金财政汇缴专户的监督管理
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