与此同时，多校区办学也逐渐成为全国高校普遍的运作模式。据教育部统计，1992年至2000年11月，全国因合并调整净减的高校达324所。许多高校在原有校园面积无法满足扩大办学规模需要时，纷纷采取新设校区的方式办学。因此，我国高校多校区办学模式大体可以分为两大类，一种是因合并形成的多校区，另一种是因新设校区形成多校区格局。2004年华南理工大学在广州大学城新设南校区，属于第二种发展模式。
　　重点理工科大学转型和多校区办学是全国高等教育大众化的客观要求和必然选择，也是改革开放步入深水区及和谐社会主题下对综合性人才要求的体现。这种教育改革给高校发展带来了历史性的机遇和严峻的挑战。清华大学依凭其强大的传统理工科优势办理法学院，优化诸学科结构，促进学科之间的交叉渗透，培养出国家亟须的厚基础、宽口径的复合型法律人才，是国内外津津乐道的重点理工科大学转型的成功尝试之一。第一个采用多校区办学模式的是美国加州大学，如今共有九个校区，包括伯克利、洛杉矶、旧金山等分校，成功屹立于世界名牌大学之林。但是，也有许多学校因合并之后“消化不良”面临诸如管理上和财务上的困境，如前不久曝光的吉林大学。2000年由原吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院等合并组建而成。2004年，原中国人民解放军军需大学并入吉林大学。2007年吉林大学负债30多亿，学校濒临破产边缘。
　　利用传统的理工科教育资源建设文科，培养复合型的高等人才显然更符合时代特色，更契合当前中国社会主义建设的人才要求。文科教育是一种入世教育，非常注重学术专业知识与人文素养的结合，有利于学校管理的人性化，有利于学生人文精神的养成，扩大学生对社会的认知视野，更有助于培养具有社会责任感的高等人才。
　　前途光明，道路却非常坎坷。首先是学校管理难度的增加。以前学校直接管理二级学院，现在增加了分校区一级，增加了管理层级，由此造成管理上的难度。如何协调学校，分校区和二级学院之间的权利责任，从而保证学校各项事务的顺利开展，必须对各个管理层级的权力进行重新分配。[3]与此同时，校区之间的距离也造成了管理成本的增加。其次，学科设置上的冲突。许多多校区之间的学科和课程出现交叉重合，这便使得老师教学和学生上课增加了时间与金钱等方面的成本。华南理工大学南北两校区呈现“南文北理”的特色，校区间相对自足，这方面问题不是很明显。第三是师生对学校的认同感以及各校区之间的交流势必出现障碍。如何充分利用理工科转型和多校区办学带来的优势，妥善处理问题和矛盾显得至关重要。

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