3、股份回购违背了股权平等原则 。股份有限公司的每一股份是等额，所包含的权利与义务也是同等的，因此同一类股票的持有者应享有平等的待遇。公司回购自己的股份可能造成公司仅仅回购某些股份而赋予特定股东以特殊利益，使同类股东之间产生不平等待遇。如果公司以其盈余利润回购自己的股份，此时公司股份的回购则是一种分配盈利的方式。那么，未出售股份给公司的股东就分享不到公司的盈余分配，从而违反股权平等原则。
每一股同类股票的持有者所承担的风险也应是同等的。当公司回购自己的股份时，相当于公司撤出一部分资本，这样一来公司经营者人为地改变了公司最初的资本结构，而该结构又是所有股东当初投资时所信赖的结构。此时，出售股份给公司的股东脱离了公司这一风险共同体，不再对公司承担任何风险，而未出售股份给公司的股东只能就该变了的公司资本结构，在公司资本额减少的情况下承担较大的风险。因此，公司股份的回购也使股东承担的风险不平等。
4、保护中小股东利益。股东的表决权要取决于所持股份的多少而有所区别。这样，掌握公司多数股份的大股东往往利用其优势地位，控制公司的经营管理，甚至可能损害广大中小股东利益。因此，必须采取必要的手段保护中小股东的利益。公司回购自己的股份，会减少公司回购已发行在外的股份总数，这样就有可能改变公司内的表决控制权。由于公司回购股份的结果是减少公司的表决权总数，同公司回购股份以前相比较，大股东控制股东会所需的股份将随之减少。因此，以前不能取得绝对优势股份的大股东，只要公司回购若干股份，即能以较少的股份轻易操纵公司，从而损害中小股东利益。因此，法律原则上禁止公司回购自己股份在某种程度上是为了保护广大中小股东的利益。
5、防止内幕交易和操纵证券交易市场的行为 。新颁布的《
中华人民共和国证券法》第
5条明文规定：“证券发行、交易活动必须遵守法律、行政法规，禁止欺诈、内幕交易和操纵证券交易市场的行为。”公司回购股份往往引起市场操纵和内幕交易。公司回购股份客观上是为了公司的生存和发展，但其后果必然会造成股价的上涨，人为地操纵股市，容易导致市场投机，对公司的股东及投资者来说是一种欺诈行为，有碍于投资者作出正确的投资判断。
二、特定情况下允许公司回购股份的法律分析
