“这是人类科学史上的一个里程碑。”人类基因组计划中国联系人杨焕明教授说，人类基因组计划的重要性，最重要的不是其科学成就本身，而是一种“精神”——在科学史上首次实现了“全世界人民一起来做一件全世界人民自己的事，所得成果也由全世界人民来共享”。但是，对于人类基因组计划的迅速发展，人类社会还没有在心理上、法律上和国际关系的格局上做好充分的准备，因而会受到巨大的冲击。
　　在基因研究过程中，发展中国家有可能被视为廉价的基因供应国，成为发达国家新的掠夺对象。我国拥有丰富的基因资源，这是一笔宝贵财富，是我国进行相关研究的独特优势，也成为某些人眼中的一块“肥肉”。“人类遗传资料与人体器官一样是个人财富，要特别注意提供者的自愿原则。”杨焕明说，必须要加强基因保护方面的立法，防止“基因殖民主义”的扩张。
　　国际人类基因组伦理学会委员邱仁宗说，在将来的基因研究成果应用过程中，人们首先面对的就是可能引起的“基因歧视”———有些人会看不起天生携带不正常基因的人。这些人很有可能被打入“另册”，在婚姻、就业、保险等各个方面受到不平等待遇，由此所引起的社会问题也会非常严重。他认为，基因没有好坏之分。英国物理学家霍金就携带可怕的肌肉萎缩基因，但这并不影响他成为最伟大的科学家之一。
　　侵犯隐私权是基因科学可能引发的另一个弊端。每个人的基因组中或多或少含有脆弱的基因或不正常的基因，它们有给人带来不良后果的潜在可能性。一个人的基因组信息是不能轻易暴露的，否则有可能直接危害其切身利益和生存空间。例如，保险是一项社会性福利，人人都有权利和机会参加，然而，你一旦暴露了自己的基因信息，很可能就被拒之门外。基因图谱可能会侵犯隐私权，这已受到法律界人士的关注。杨焕明教授说，个人遗传信息应看成是一个人的隐私，而不是一般的医学数据，不必也不应该公布于天下。
　　最为可怕的是基因武器可以杀人于无形之中。某些疯狂又自以为是的国家或个人，出于某种不纯的动机去克隆人，如前面提到的邪教组织——“拉尔雷恩运动”就是因为坚信地球上的人类都是一群外星球科学家从另一个星球上克隆来的，所以他们克隆人来证明他们的理论。甚至可能有人会利用基因研究成果开发“基因武器”，通过研究不同种族、不同人群的特异性基因，采用特定的基因生物武器作用于目标种族或人群，从而导致该种族或人群的毁灭！
　　另外，也可能出现这种情况：人们有可能按照一种模式设计自己后代的形象，使亿万人之间由此缺少差别性，而这种差别性对人类的延续来讲，却是生死攸关的。而且，对人类自身基因的改造，其后果往往要经过相当长时间的繁衍才能看出来，由此，对人类自身基因的无序改造，就可能造成难以逆转的恶果。美国著名基因科学家爱里克·兰德尔呼吁：在对基因科学有进一步了解之前，应禁止对人类进行基因改变的实验。基因研究要有“准入”制度。什么可以研究，什么样的研究要接受审查，要有法律条文来约束。

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