企业搬迁补偿的问题

本厂属于村办集体企业，由1996年开始承包给我家私人经营，自负盈亏，土地和部分设施属于村里所有，08年因洪灾所有设施也基本损毁，基本上生产经营所需的设施和设备都是我个人投资新建和维修，06年因生产经营需要，经过村里同意在厂内兴建房产一栋，但没有证，现因此土地已经被村里转让给其他单位，要求我们搬迁，村里现在给的条件是按照本地私房拆迁补偿办法只补偿我06年兴建的房产，其他财产都属于村里所有。请问这样合理吗？我从1996年开始之今的投资怎么办？1998年以前的投资和因洪灾造成的损失因不因该算在投资内？按照法律政府应该怎么补偿，搬迁的费用和停产停业的损失应该谁来负责？忘各位法律专家给以解答，为感！