房屋财产如何分割

我父亲有一套二房子，于1988年在母亲在世时分得，并交付了一部分房款，母亲于1994年过世，父亲在1996年又付了一部分房款，父亲在1997年再婚，在他们婚后，我们拿到了房产证，该房一直由父亲及继母居住，父亲于今年10月9号去世，10月13号继母说该房已经全部属于她的个人财产，因为我的父亲在世时，已经把房子到金牛区公证处作了公证，说房子归她一人所有。而且已经把房子过户给了她，刚刚律师已经回复我们子女有生母那部分的继承权，我想咨询一下，像这种情况，我母亲有好多？因为房子当时是房改房，买得很便宜，那现在是按照现在房屋增值部分算还是按照大拿过世购买价格算？